Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdh8D3Z6W3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdh8D3Z6W3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdh8D3Z6W3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdh8D3Z6W3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdh8D3Z6W3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdh8D3Z6W3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdh8D3Z6W3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdh8D3Z6W3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdh8D3Z6W3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdh8D3Z6W3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdh8D3Z6W3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdh8D3Z6W3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdh8D3Z6W3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdh8D3Z6W3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdh8D3Z6W3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh8D3Z6W3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh8D3Z6W3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh8D3Z6W3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh8D3Z6W3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh8D3Z6W3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh8D3Z6W3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh8D3Z6W3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh8D3Z6W3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh8D3Z6W3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh8D3Z6W3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh8D3Z6W3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh8D3Z6W3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdh8D3Z6W3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdh8D3Z6W3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdh8D3Z6W3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdh8D3Z6W3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdh8D3Z6W3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdh8D3Z6W3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdh8D3Z6W3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdh8D3Z6W3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdh8D3Z6W3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdh8D3Z6W3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdh8D3Z6W3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdh8D3Z6W3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdh8D3Z6W3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdh8D3Z6W3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdh8D3Z6W3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdh8D3Z6W3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdh8D3Z6W3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdh8D3Z6W3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdh8D3Z6W3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh8D3Z6W3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh8D3Z6W3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh8D3Z6W3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh8D3Z6W3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh8D3Z6W3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh8D3Z6W3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh8D3Z6W3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh8D3Z6W3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh8D3Z6W3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh8D3Z6W3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh8D3Z6W3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh8D3Z6W3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh8D3Z6W3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh8D3Z6W3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh8D3Z6W3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh8D3Z6W3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh8D3Z6W3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh8D3Z6W3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh8D3Z6W3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh8D3Z6W3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh8D3Z6W3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh8D3Z6W3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh8D3Z6W3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh8D3Z6W3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rdh8D3Z6W3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rdh8D3Z6W3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rdh8D3Z6W3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rdh8D3Z6W3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rdh8D3Z6W3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rdh8D3Z6W3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rdh8D3Z6W3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rdh8D3Z6W3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rdh8D3Z6W3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms