Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5L4

5430403G16Rik, RIKEN cDNA 5430403G16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430403G16RikD3Z5L4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
5430403G16RikD3Z5L4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
5430403G16RikD3Z5L4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
5430403G16RikD3Z5L4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
5430403G16RikD3Z5L4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
5430403G16RikD3Z5L4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
5430403G16RikD3Z5L4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
5430403G16RikD3Z5L4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
5430403G16RikD3Z5L4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
5430403G16RikD3Z5L4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
5430403G16RikD3Z5L4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
5430403G16RikD3Z5L4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
5430403G16RikD3Z5L4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
5430403G16RikD3Z5L4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
5430403G16RikD3Z5L4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
5430403G16RikD3Z5L4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
5430403G16RikD3Z5L4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
5430403G16RikD3Z5L4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
5430403G16RikD3Z5L4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
5430403G16RikD3Z5L4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
5430403G16RikD3Z5L4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
5430403G16RikD3Z5L4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
5430403G16RikD3Z5L4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
5430403G16RikD3Z5L4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
5430403G16RikD3Z5L4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
5430403G16RikD3Z5L4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
5430403G16RikD3Z5L4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
5430403G16RikD3Z5L4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
5430403G16RikD3Z5L4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
5430403G16RikD3Z5L4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
5430403G16RikD3Z5L4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
5430403G16RikD3Z5L4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
5430403G16RikD3Z5L4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
5430403G16RikD3Z5L4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
5430403G16RikD3Z5L4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
5430403G16RikD3Z5L4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
5430403G16RikD3Z5L4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
5430403G16RikD3Z5L4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
5430403G16RikD3Z5L4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
5430403G16RikD3Z5L4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
5430403G16RikD3Z5L4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
5430403G16RikD3Z5L4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
5430403G16RikD3Z5L4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
5430403G16RikD3Z5L4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
5430403G16RikD3Z5L4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
5430403G16RikD3Z5L4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
5430403G16RikD3Z5L4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
5430403G16RikD3Z5L4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
5430403G16RikD3Z5L4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
5430403G16RikD3Z5L4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
5430403G16RikD3Z5L4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
5430403G16RikD3Z5L4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
5430403G16RikD3Z5L4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
5430403G16RikD3Z5L4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
5430403G16RikD3Z5L4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
5430403G16RikD3Z5L4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
5430403G16RikD3Z5L4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
5430403G16RikD3Z5L4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
5430403G16RikD3Z5L4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
5430403G16RikD3Z5L4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
5430403G16RikD3Z5L4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
5430403G16RikD3Z5L4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
5430403G16RikD3Z5L4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
5430403G16RikD3Z5L4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
5430403G16RikD3Z5L4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
5430403G16RikD3Z5L4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
5430403G16RikD3Z5L4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
5430403G16RikD3Z5L4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
5430403G16RikD3Z5L4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
5430403G16RikD3Z5L4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
5430403G16RikD3Z5L4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
5430403G16RikD3Z5L4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
5430403G16RikD3Z5L4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
5430403G16RikD3Z5L4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
5430403G16RikD3Z5L4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
5430403G16RikD3Z5L4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
5430403G16RikD3Z5L4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
5430403G16RikD3Z5L4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
5430403G16RikD3Z5L4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
5430403G16RikD3Z5L4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
5430403G16RikD3Z5L4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
5430403G16RikD3Z5L4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
5430403G16RikD3Z5L4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
5430403G16RikD3Z5L4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
5430403G16RikD3Z5L4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
5430403G16RikD3Z5L4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
5430403G16RikD3Z5L4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
5430403G16RikD3Z5L4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
5430403G16RikD3Z5L4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
5430403G16RikD3Z5L4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
5430403G16RikD3Z5L4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
5430403G16RikD3Z5L4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
5430403G16RikD3Z5L4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
5430403G16RikD3Z5L4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
5430403G16RikD3Z5L4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
5430403G16RikD3Z5L4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
5430403G16RikD3Z5L4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
5430403G16RikD3Z5L4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
5430403G16RikD3Z5L4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
5430403G16RikD3Z5L4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms