Protein–RNA interactions for Protein: D3Z536

Gm8225, Predicted gene 8225, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8225D3Z536 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8225D3Z536 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms