Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms