Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1V9

Defa28, Defensin, alpha, 28, mousemouse

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa28D3Z1V9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa28D3Z1V9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa28D3Z1V9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa28D3Z1V9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa28D3Z1V9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa28D3Z1V9 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa28D3Z1V9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa28D3Z1V9 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa28D3Z1V9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms