Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ5

Tmed7, Transmembrane p24-trafficking protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed7D3YZZ5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmed7D3YZZ5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmed7D3YZZ5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmed7D3YZZ5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmed7D3YZZ5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmed7D3YZZ5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmed7D3YZZ5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmed7D3YZZ5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmed7D3YZZ5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmed7D3YZZ5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmed7D3YZZ5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmed7D3YZZ5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmed7D3YZZ5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmed7D3YZZ5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmed7D3YZZ5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmed7D3YZZ5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmed7D3YZZ5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmed7D3YZZ5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmed7D3YZZ5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmed7D3YZZ5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmed7D3YZZ5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmed7D3YZZ5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmed7D3YZZ5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmed7D3YZZ5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmed7D3YZZ5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmed7D3YZZ5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmed7D3YZZ5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmed7D3YZZ5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmed7D3YZZ5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmed7D3YZZ5 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmed7D3YZZ5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmed7D3YZZ5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmed7D3YZZ5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmed7D3YZZ5 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmed7D3YZZ5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmed7D3YZZ5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmed7D3YZZ5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmed7D3YZZ5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmed7D3YZZ5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmed7D3YZZ5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmed7D3YZZ5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmed7D3YZZ5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmed7D3YZZ5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmed7D3YZZ5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmed7D3YZZ5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmed7D3YZZ5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmed7D3YZZ5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmed7D3YZZ5 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmed7D3YZZ5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmed7D3YZZ5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmed7D3YZZ5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmed7D3YZZ5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmed7D3YZZ5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmed7D3YZZ5 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmed7D3YZZ5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmed7D3YZZ5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmed7D3YZZ5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmed7D3YZZ5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed7D3YZZ5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed7D3YZZ5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed7D3YZZ5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed7D3YZZ5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed7D3YZZ5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed7D3YZZ5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed7D3YZZ5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed7D3YZZ5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed7D3YZZ5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed7D3YZZ5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed7D3YZZ5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed7D3YZZ5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed7D3YZZ5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed7D3YZZ5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed7D3YZZ5 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed7D3YZZ5 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed7D3YZZ5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed7D3YZZ5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed7D3YZZ5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tmed7D3YZZ5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed7D3YZZ5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed7D3YZZ5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed7D3YZZ5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed7D3YZZ5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed7D3YZZ5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed7D3YZZ5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed7D3YZZ5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed7D3YZZ5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed7D3YZZ5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed7D3YZZ5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed7D3YZZ5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed7D3YZZ5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed7D3YZZ5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed7D3YZZ5 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed7D3YZZ5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed7D3YZZ5 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed7D3YZZ5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed7D3YZZ5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed7D3YZZ5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed7D3YZZ5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed7D3YZZ5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmed7D3YZZ5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms