Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc13D3YV10 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc13D3YV10 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc13D3YV10 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc13D3YV10 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc13D3YV10 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc13D3YV10 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms