Protein–RNA interactions for Protein: C0HKC9

Smok3b, Sperm motility kinase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smok3bC0HKC9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smok3bC0HKC9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms