Protein–RNA interactions for Protein: B2RX70

Cped1, Cadherin-like and PC-esterase domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cped1B2RX70 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cped1B2RX70 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cped1B2RX70 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cped1B2RX70 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cped1B2RX70 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cped1B2RX70 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cped1B2RX70 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cped1B2RX70 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cped1B2RX70 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cped1B2RX70 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cped1B2RX70 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cped1B2RX70 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cped1B2RX70 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cped1B2RX70 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cped1B2RX70 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cped1B2RX70 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cped1B2RX70 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cped1B2RX70 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cped1B2RX70 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cped1B2RX70 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cped1B2RX70 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cped1B2RX70 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cped1B2RX70 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cped1B2RX70 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cped1B2RX70 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cped1B2RX70 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cped1B2RX70 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cped1B2RX70 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cped1B2RX70 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cped1B2RX70 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cped1B2RX70 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cped1B2RX70 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cped1B2RX70 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cped1B2RX70 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cped1B2RX70 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cped1B2RX70 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cped1B2RX70 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cped1B2RX70 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cped1B2RX70 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cped1B2RX70 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cped1B2RX70 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cped1B2RX70 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cped1B2RX70 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cped1B2RX70 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cped1B2RX70 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cped1B2RX70 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cped1B2RX70 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cped1B2RX70 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cped1B2RX70 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cped1B2RX70 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cped1B2RX70 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Cped1B2RX70 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cped1B2RX70 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cped1B2RX70 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cped1B2RX70 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cped1B2RX70 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cped1B2RX70 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cped1B2RX70 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cped1B2RX70 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cped1B2RX70 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cped1B2RX70 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cped1B2RX70 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cped1B2RX70 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cped1B2RX70 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Cped1B2RX70 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Cped1B2RX70 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cped1B2RX70 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cped1B2RX70 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cped1B2RX70 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cped1B2RX70 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cped1B2RX70 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cped1B2RX70 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cped1B2RX70 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cped1B2RX70 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cped1B2RX70 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cped1B2RX70 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cped1B2RX70 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cped1B2RX70 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cped1B2RX70 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cped1B2RX70 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cped1B2RX70 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cped1B2RX70 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cped1B2RX70 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cped1B2RX70 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cped1B2RX70 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cped1B2RX70 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cped1B2RX70 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cped1B2RX70 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cped1B2RX70 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cped1B2RX70 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cped1B2RX70 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cped1B2RX70 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cped1B2RX70 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cped1B2RX70 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cped1B2RX70 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cped1B2RX70 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cped1B2RX70 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cped1B2RX70 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cped1B2RX70 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cped1B2RX70 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms