Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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