Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apol7aB2RT54 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apol7aB2RT54 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apol7aB2RT54 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Apol7aB2RT54 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apol7aB2RT54 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apol7aB2RT54 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apol7aB2RT54 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Apol7aB2RT54 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Apol7aB2RT54 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apol7aB2RT54 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Apol7aB2RT54 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apol7aB2RT54 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apol7aB2RT54 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apol7aB2RT54 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Apol7aB2RT54 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Apol7aB2RT54 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apol7aB2RT54 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apol7aB2RT54 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apol7aB2RT54 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apol7aB2RT54 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apol7aB2RT54 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apol7aB2RT54 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apol7aB2RT54 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apol7aB2RT54 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apol7aB2RT54 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apol7aB2RT54 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apol7aB2RT54 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apol7aB2RT54 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apol7aB2RT54 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apol7aB2RT54 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apol7aB2RT54 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apol7aB2RT54 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apol7aB2RT54 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Apol7aB2RT54 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apol7aB2RT54 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apol7aB2RT54 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apol7aB2RT54 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apol7aB2RT54 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apol7aB2RT54 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apol7aB2RT54 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apol7aB2RT54 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apol7aB2RT54 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apol7aB2RT54 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apol7aB2RT54 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apol7aB2RT54 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apol7aB2RT54 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apol7aB2RT54 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apol7aB2RT54 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apol7aB2RT54 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apol7aB2RT54 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apol7aB2RT54 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apol7aB2RT54 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apol7aB2RT54 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apol7aB2RT54 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apol7aB2RT54 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apol7aB2RT54 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apol7aB2RT54 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apol7aB2RT54 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apol7aB2RT54 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apol7aB2RT54 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apol7aB2RT54 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Apol7aB2RT54 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apol7aB2RT54 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apol7aB2RT54 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apol7aB2RT54 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apol7aB2RT54 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apol7aB2RT54 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apol7aB2RT54 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apol7aB2RT54 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apol7aB2RT54 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apol7aB2RT54 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apol7aB2RT54 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apol7aB2RT54 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apol7aB2RT54 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apol7aB2RT54 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apol7aB2RT54 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Apol7aB2RT54 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apol7aB2RT54 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apol7aB2RT54 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apol7aB2RT54 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apol7aB2RT54 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apol7aB2RT54 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apol7aB2RT54 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apol7aB2RT54 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apol7aB2RT54 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apol7aB2RT54 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apol7aB2RT54 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apol7aB2RT54 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apol7aB2RT54 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apol7aB2RT54 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apol7aB2RT54 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apol7aB2RT54 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apol7aB2RT54 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apol7aB2RT54 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apol7aB2RT54 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apol7aB2RT54 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apol7aB2RT54 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apol7aB2RT54 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apol7aB2RT54 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms