Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Ythdc2B2RR83 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Ythdc2B2RR83 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ythdc2B2RR83 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ythdc2B2RR83 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Ythdc2B2RR83 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ythdc2B2RR83 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ythdc2B2RR83 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ythdc2B2RR83 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ythdc2B2RR83 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ythdc2B2RR83 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ythdc2B2RR83 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Ythdc2B2RR83 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ythdc2B2RR83 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ythdc2B2RR83 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ythdc2B2RR83 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ythdc2B2RR83 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ythdc2B2RR83 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ythdc2B2RR83 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ythdc2B2RR83 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ythdc2B2RR83 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ythdc2B2RR83 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Ythdc2B2RR83 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Ythdc2B2RR83 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ythdc2B2RR83 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ythdc2B2RR83 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ythdc2B2RR83 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ythdc2B2RR83 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ythdc2B2RR83 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ythdc2B2RR83 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ythdc2B2RR83 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ythdc2B2RR83 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ythdc2B2RR83 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ythdc2B2RR83 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ythdc2B2RR83 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ythdc2B2RR83 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ythdc2B2RR83 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ythdc2B2RR83 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Ythdc2B2RR83 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ythdc2B2RR83 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ythdc2B2RR83 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ythdc2B2RR83 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ythdc2B2RR83 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ythdc2B2RR83 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ythdc2B2RR83 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ythdc2B2RR83 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ythdc2B2RR83 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ythdc2B2RR83 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ythdc2B2RR83 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ythdc2B2RR83 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ythdc2B2RR83 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ythdc2B2RR83 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ythdc2B2RR83 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ythdc2B2RR83 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Ythdc2B2RR83 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ythdc2B2RR83 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ythdc2B2RR83 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ythdc2B2RR83 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ythdc2B2RR83 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ythdc2B2RR83 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ythdc2B2RR83 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ythdc2B2RR83 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ythdc2B2RR83 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ythdc2B2RR83 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ythdc2B2RR83 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ythdc2B2RR83 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ythdc2B2RR83 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ythdc2B2RR83 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ythdc2B2RR83 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ythdc2B2RR83 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ythdc2B2RR83 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ythdc2B2RR83 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ythdc2B2RR83 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ythdc2B2RR83 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ythdc2B2RR83 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ythdc2B2RR83 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Ythdc2B2RR83 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ythdc2B2RR83 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ythdc2B2RR83 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ythdc2B2RR83 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ythdc2B2RR83 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ythdc2B2RR83 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ythdc2B2RR83 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ythdc2B2RR83 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ythdc2B2RR83 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ythdc2B2RR83 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ythdc2B2RR83 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Ythdc2B2RR83 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Ythdc2B2RR83 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ythdc2B2RR83 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ythdc2B2RR83 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ythdc2B2RR83 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ythdc2B2RR83 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ythdc2B2RR83 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ythdc2B2RR83 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ythdc2B2RR83 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ythdc2B2RR83 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ythdc2B2RR83 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ythdc2B2RR83 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ythdc2B2RR83 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms