Protein–RNA interactions for Protein: B2RQY6

BC035947, BC035947 protein, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035947B2RQY6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BC035947B2RQY6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BC035947B2RQY6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BC035947B2RQY6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BC035947B2RQY6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BC035947B2RQY6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BC035947B2RQY6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BC035947B2RQY6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BC035947B2RQY6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BC035947B2RQY6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BC035947B2RQY6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BC035947B2RQY6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
BC035947B2RQY6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BC035947B2RQY6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BC035947B2RQY6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BC035947B2RQY6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BC035947B2RQY6 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
BC035947B2RQY6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BC035947B2RQY6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BC035947B2RQY6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BC035947B2RQY6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BC035947B2RQY6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BC035947B2RQY6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BC035947B2RQY6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BC035947B2RQY6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BC035947B2RQY6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BC035947B2RQY6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BC035947B2RQY6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BC035947B2RQY6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BC035947B2RQY6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
BC035947B2RQY6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
BC035947B2RQY6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BC035947B2RQY6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BC035947B2RQY6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BC035947B2RQY6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
BC035947B2RQY6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BC035947B2RQY6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BC035947B2RQY6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
BC035947B2RQY6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BC035947B2RQY6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BC035947B2RQY6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BC035947B2RQY6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BC035947B2RQY6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BC035947B2RQY6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
BC035947B2RQY6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BC035947B2RQY6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BC035947B2RQY6 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BC035947B2RQY6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BC035947B2RQY6 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BC035947B2RQY6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BC035947B2RQY6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BC035947B2RQY6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BC035947B2RQY6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BC035947B2RQY6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BC035947B2RQY6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BC035947B2RQY6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BC035947B2RQY6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BC035947B2RQY6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BC035947B2RQY6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BC035947B2RQY6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BC035947B2RQY6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BC035947B2RQY6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BC035947B2RQY6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
BC035947B2RQY6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BC035947B2RQY6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BC035947B2RQY6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BC035947B2RQY6 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
BC035947B2RQY6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BC035947B2RQY6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BC035947B2RQY6 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BC035947B2RQY6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BC035947B2RQY6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BC035947B2RQY6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BC035947B2RQY6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BC035947B2RQY6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BC035947B2RQY6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BC035947B2RQY6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BC035947B2RQY6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BC035947B2RQY6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BC035947B2RQY6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BC035947B2RQY6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BC035947B2RQY6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BC035947B2RQY6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BC035947B2RQY6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BC035947B2RQY6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BC035947B2RQY6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BC035947B2RQY6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BC035947B2RQY6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BC035947B2RQY6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BC035947B2RQY6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BC035947B2RQY6 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BC035947B2RQY6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BC035947B2RQY6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BC035947B2RQY6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BC035947B2RQY6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BC035947B2RQY6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BC035947B2RQY6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BC035947B2RQY6 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BC035947B2RQY6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BC035947B2RQY6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms