Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

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Length 756 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms