Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1B2KF50 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1B2KF50 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1B2KF50 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1B2KF50 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1B2KF50 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1B2KF50 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1B2KF50 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1B2KF50 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1B2KF50 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1B2KF50 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1B2KF50 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1B2KF50 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1B2KF50 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1B2KF50 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1B2KF50 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1B2KF50 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1B2KF50 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1B2KF50 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1B2KF50 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1B2KF50 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1B2KF50 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1B2KF50 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1B2KF50 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1B2KF50 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1B2KF50 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1B2KF50 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1B2KF50 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1B2KF50 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1B2KF50 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1B2KF50 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1B2KF50 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1B2KF50 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1B2KF50 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1B2KF50 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1B2KF50 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1B2KF50 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1B2KF50 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1B2KF50 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1B2KF50 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1B2KF50 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1B2KF50 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1B2KF50 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1B2KF50 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1B2KF50 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1B2KF50 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1B2KF50 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1B2KF50 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1B2KF50 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1B2KF50 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1B2KF50 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1B2KF50 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1B2KF50 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1B2KF50 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1B2KF50 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1B2KF50 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1B2KF50 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1B2KF50 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1B2KF50 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1B2KF50 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1B2KF50 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1B2KF50 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1B2KF50 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1B2KF50 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1B2KF50 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1B2KF50 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1B2KF50 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1B2KF50 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1B2KF50 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1B2KF50 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1B2KF50 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1B2KF50 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1B2KF50 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1B2KF50 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1B2KF50 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1B2KF50 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1B2KF50 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1B2KF50 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1B2KF50 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1B2KF50 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1B2KF50 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1B2KF50 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1B2KF50 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1B2KF50 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms