Protein–RNA interactions for Protein: B1AYL1

Scn7a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn7aB1AYL1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scn7aB1AYL1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scn7aB1AYL1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Scn7aB1AYL1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Scn7aB1AYL1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Scn7aB1AYL1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Scn7aB1AYL1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Scn7aB1AYL1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Scn7aB1AYL1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Scn7aB1AYL1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Scn7aB1AYL1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scn7aB1AYL1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scn7aB1AYL1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scn7aB1AYL1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scn7aB1AYL1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scn7aB1AYL1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scn7aB1AYL1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Scn7aB1AYL1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scn7aB1AYL1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scn7aB1AYL1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Scn7aB1AYL1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Scn7aB1AYL1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Scn7aB1AYL1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Scn7aB1AYL1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Scn7aB1AYL1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Scn7aB1AYL1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Scn7aB1AYL1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Scn7aB1AYL1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Scn7aB1AYL1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Scn7aB1AYL1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Scn7aB1AYL1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Scn7aB1AYL1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scn7aB1AYL1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scn7aB1AYL1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scn7aB1AYL1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scn7aB1AYL1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Scn7aB1AYL1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scn7aB1AYL1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scn7aB1AYL1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scn7aB1AYL1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scn7aB1AYL1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scn7aB1AYL1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scn7aB1AYL1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scn7aB1AYL1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Scn7aB1AYL1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Scn7aB1AYL1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Scn7aB1AYL1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Scn7aB1AYL1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Scn7aB1AYL1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Scn7aB1AYL1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Scn7aB1AYL1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Scn7aB1AYL1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Scn7aB1AYL1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scn7aB1AYL1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Scn7aB1AYL1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scn7aB1AYL1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scn7aB1AYL1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scn7aB1AYL1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scn7aB1AYL1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Scn7aB1AYL1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scn7aB1AYL1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scn7aB1AYL1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scn7aB1AYL1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scn7aB1AYL1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scn7aB1AYL1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Scn7aB1AYL1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scn7aB1AYL1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scn7aB1AYL1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scn7aB1AYL1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Scn7aB1AYL1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scn7aB1AYL1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scn7aB1AYL1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scn7aB1AYL1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scn7aB1AYL1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scn7aB1AYL1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scn7aB1AYL1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scn7aB1AYL1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scn7aB1AYL1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scn7aB1AYL1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scn7aB1AYL1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scn7aB1AYL1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Scn7aB1AYL1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Scn7aB1AYL1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Scn7aB1AYL1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Scn7aB1AYL1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Scn7aB1AYL1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Scn7aB1AYL1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Scn7aB1AYL1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scn7aB1AYL1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scn7aB1AYL1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scn7aB1AYL1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Scn7aB1AYL1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Scn7aB1AYL1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scn7aB1AYL1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scn7aB1AYL1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scn7aB1AYL1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scn7aB1AYL1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scn7aB1AYL1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Scn7aB1AYL1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scn7aB1AYL1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms