Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB3

Gm438, MCG65768, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm438B1ASB3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm438B1ASB3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm438B1ASB3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm438B1ASB3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms