Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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