Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2-M5A7VMS3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms