Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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