Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scn3aA2ASI5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scn3aA2ASI5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scn3aA2ASI5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scn3aA2ASI5 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scn3aA2ASI5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scn3aA2ASI5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scn3aA2ASI5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scn3aA2ASI5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scn3aA2ASI5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scn3aA2ASI5 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scn3aA2ASI5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scn3aA2ASI5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Scn3aA2ASI5 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Scn3aA2ASI5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scn3aA2ASI5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scn3aA2ASI5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scn3aA2ASI5 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Scn3aA2ASI5 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Scn3aA2ASI5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Scn3aA2ASI5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Scn3aA2ASI5 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Scn3aA2ASI5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Scn3aA2ASI5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Scn3aA2ASI5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Scn3aA2ASI5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Scn3aA2ASI5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Scn3aA2ASI5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Scn3aA2ASI5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Scn3aA2ASI5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scn3aA2ASI5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scn3aA2ASI5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scn3aA2ASI5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scn3aA2ASI5 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Scn3aA2ASI5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scn3aA2ASI5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scn3aA2ASI5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scn3aA2ASI5 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scn3aA2ASI5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scn3aA2ASI5 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scn3aA2ASI5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scn3aA2ASI5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scn3aA2ASI5 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Scn3aA2ASI5 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scn3aA2ASI5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scn3aA2ASI5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scn3aA2ASI5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scn3aA2ASI5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scn3aA2ASI5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scn3aA2ASI5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scn3aA2ASI5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scn3aA2ASI5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scn3aA2ASI5 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scn3aA2ASI5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Scn3aA2ASI5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scn3aA2ASI5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Scn3aA2ASI5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scn3aA2ASI5 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scn3aA2ASI5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scn3aA2ASI5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scn3aA2ASI5 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scn3aA2ASI5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scn3aA2ASI5 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scn3aA2ASI5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scn3aA2ASI5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scn3aA2ASI5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scn3aA2ASI5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scn3aA2ASI5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scn3aA2ASI5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scn3aA2ASI5 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scn3aA2ASI5 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Scn3aA2ASI5 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Scn3aA2ASI5 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Scn3aA2ASI5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scn3aA2ASI5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scn3aA2ASI5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scn3aA2ASI5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scn3aA2ASI5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scn3aA2ASI5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scn3aA2ASI5 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scn3aA2ASI5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scn3aA2ASI5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scn3aA2ASI5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scn3aA2ASI5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scn3aA2ASI5 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scn3aA2ASI5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scn3aA2ASI5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scn3aA2ASI5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scn3aA2ASI5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scn3aA2ASI5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scn3aA2ASI5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Scn3aA2ASI5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Scn3aA2ASI5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Scn3aA2ASI5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Scn3aA2ASI5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Scn3aA2ASI5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Scn3aA2ASI5 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Scn3aA2ASI5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Scn3aA2ASI5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Scn3aA2ASI5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms