Protein–RNA interactions for Protein: A2ARM1

Patl2, Protein PAT1 homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Patl2A2ARM1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Patl2A2ARM1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Patl2A2ARM1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Patl2A2ARM1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Patl2A2ARM1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Patl2A2ARM1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Patl2A2ARM1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Patl2A2ARM1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Patl2A2ARM1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Patl2A2ARM1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Patl2A2ARM1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Patl2A2ARM1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Patl2A2ARM1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Patl2A2ARM1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Patl2A2ARM1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Patl2A2ARM1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Patl2A2ARM1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Patl2A2ARM1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Patl2A2ARM1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Patl2A2ARM1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Patl2A2ARM1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Patl2A2ARM1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Patl2A2ARM1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Patl2A2ARM1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Patl2A2ARM1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Patl2A2ARM1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Patl2A2ARM1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Patl2A2ARM1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Patl2A2ARM1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Patl2A2ARM1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Patl2A2ARM1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Patl2A2ARM1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Patl2A2ARM1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Patl2A2ARM1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Patl2A2ARM1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Patl2A2ARM1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Patl2A2ARM1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Patl2A2ARM1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Patl2A2ARM1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Patl2A2ARM1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Patl2A2ARM1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Patl2A2ARM1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Patl2A2ARM1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Patl2A2ARM1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Patl2A2ARM1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Patl2A2ARM1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Patl2A2ARM1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Patl2A2ARM1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Patl2A2ARM1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Patl2A2ARM1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Patl2A2ARM1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Patl2A2ARM1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Patl2A2ARM1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Patl2A2ARM1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Patl2A2ARM1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Patl2A2ARM1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Patl2A2ARM1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Patl2A2ARM1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Patl2A2ARM1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Patl2A2ARM1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Patl2A2ARM1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Patl2A2ARM1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Patl2A2ARM1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Patl2A2ARM1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Patl2A2ARM1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Patl2A2ARM1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Patl2A2ARM1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Patl2A2ARM1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Patl2A2ARM1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Patl2A2ARM1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Patl2A2ARM1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Patl2A2ARM1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Patl2A2ARM1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Patl2A2ARM1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Patl2A2ARM1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Patl2A2ARM1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Patl2A2ARM1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Patl2A2ARM1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Patl2A2ARM1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Patl2A2ARM1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Patl2A2ARM1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Patl2A2ARM1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Patl2A2ARM1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Patl2A2ARM1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Patl2A2ARM1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Patl2A2ARM1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Patl2A2ARM1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Patl2A2ARM1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Patl2A2ARM1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Patl2A2ARM1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Patl2A2ARM1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Patl2A2ARM1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Patl2A2ARM1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Patl2A2ARM1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Patl2A2ARM1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Patl2A2ARM1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Patl2A2ARM1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Patl2A2ARM1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Patl2A2ARM1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Patl2A2ARM1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms