Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms