Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GabreA2AMW3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GabreA2AMW3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GabreA2AMW3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GabreA2AMW3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GabreA2AMW3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GabreA2AMW3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GabreA2AMW3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GabreA2AMW3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GabreA2AMW3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GabreA2AMW3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GabreA2AMW3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GabreA2AMW3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GabreA2AMW3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GabreA2AMW3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GabreA2AMW3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GabreA2AMW3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GabreA2AMW3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GabreA2AMW3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GabreA2AMW3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GabreA2AMW3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GabreA2AMW3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
GabreA2AMW3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
GabreA2AMW3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
GabreA2AMW3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GabreA2AMW3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GabreA2AMW3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GabreA2AMW3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GabreA2AMW3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GabreA2AMW3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GabreA2AMW3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GabreA2AMW3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GabreA2AMW3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GabreA2AMW3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GabreA2AMW3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GabreA2AMW3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GabreA2AMW3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GabreA2AMW3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GabreA2AMW3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GabreA2AMW3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GabreA2AMW3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GabreA2AMW3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GabreA2AMW3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GabreA2AMW3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GabreA2AMW3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GabreA2AMW3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GabreA2AMW3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GabreA2AMW3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GabreA2AMW3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GabreA2AMW3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GabreA2AMW3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GabreA2AMW3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GabreA2AMW3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GabreA2AMW3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GabreA2AMW3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GabreA2AMW3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GabreA2AMW3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GabreA2AMW3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GabreA2AMW3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GabreA2AMW3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GabreA2AMW3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GabreA2AMW3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GabreA2AMW3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GabreA2AMW3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GabreA2AMW3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GabreA2AMW3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GabreA2AMW3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GabreA2AMW3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GabreA2AMW3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GabreA2AMW3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GabreA2AMW3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GabreA2AMW3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GabreA2AMW3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GabreA2AMW3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GabreA2AMW3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GabreA2AMW3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GabreA2AMW3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GabreA2AMW3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GabreA2AMW3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GabreA2AMW3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GabreA2AMW3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GabreA2AMW3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GabreA2AMW3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GabreA2AMW3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GabreA2AMW3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GabreA2AMW3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GabreA2AMW3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GabreA2AMW3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GabreA2AMW3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GabreA2AMW3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GabreA2AMW3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GabreA2AMW3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GabreA2AMW3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GabreA2AMW3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GabreA2AMW3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GabreA2AMW3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GabreA2AMW3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GabreA2AMW3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GabreA2AMW3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GabreA2AMW3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms