Protein–RNA interactions for Protein: A2AKG8

Focad, Focadhesin, mousemouse

Predictions only

Length 1,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FocadA2AKG8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FocadA2AKG8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FocadA2AKG8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FocadA2AKG8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FocadA2AKG8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FocadA2AKG8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FocadA2AKG8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FocadA2AKG8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FocadA2AKG8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FocadA2AKG8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FocadA2AKG8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FocadA2AKG8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FocadA2AKG8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FocadA2AKG8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FocadA2AKG8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FocadA2AKG8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FocadA2AKG8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FocadA2AKG8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FocadA2AKG8 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FocadA2AKG8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FocadA2AKG8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FocadA2AKG8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FocadA2AKG8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FocadA2AKG8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FocadA2AKG8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FocadA2AKG8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FocadA2AKG8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FocadA2AKG8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FocadA2AKG8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FocadA2AKG8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FocadA2AKG8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FocadA2AKG8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FocadA2AKG8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FocadA2AKG8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FocadA2AKG8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FocadA2AKG8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FocadA2AKG8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FocadA2AKG8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FocadA2AKG8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FocadA2AKG8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FocadA2AKG8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FocadA2AKG8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FocadA2AKG8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FocadA2AKG8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FocadA2AKG8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FocadA2AKG8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FocadA2AKG8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FocadA2AKG8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FocadA2AKG8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FocadA2AKG8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FocadA2AKG8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FocadA2AKG8 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FocadA2AKG8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FocadA2AKG8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FocadA2AKG8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FocadA2AKG8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FocadA2AKG8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FocadA2AKG8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FocadA2AKG8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FocadA2AKG8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FocadA2AKG8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FocadA2AKG8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FocadA2AKG8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FocadA2AKG8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FocadA2AKG8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FocadA2AKG8 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FocadA2AKG8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FocadA2AKG8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FocadA2AKG8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FocadA2AKG8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FocadA2AKG8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FocadA2AKG8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FocadA2AKG8 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FocadA2AKG8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FocadA2AKG8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FocadA2AKG8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FocadA2AKG8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FocadA2AKG8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FocadA2AKG8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FocadA2AKG8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FocadA2AKG8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FocadA2AKG8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FocadA2AKG8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FocadA2AKG8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FocadA2AKG8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FocadA2AKG8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FocadA2AKG8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FocadA2AKG8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FocadA2AKG8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FocadA2AKG8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FocadA2AKG8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FocadA2AKG8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FocadA2AKG8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
FocadA2AKG8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FocadA2AKG8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FocadA2AKG8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FocadA2AKG8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FocadA2AKG8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FocadA2AKG8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FocadA2AKG8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms