Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Frmpd1A2AKB4 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Frmpd1A2AKB4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Frmpd1A2AKB4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Frmpd1A2AKB4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Frmpd1A2AKB4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Frmpd1A2AKB4 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Frmpd1A2AKB4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Frmpd1A2AKB4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Frmpd1A2AKB4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Frmpd1A2AKB4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Frmpd1A2AKB4 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Frmpd1A2AKB4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Frmpd1A2AKB4 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Frmpd1A2AKB4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Frmpd1A2AKB4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Frmpd1A2AKB4 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Frmpd1A2AKB4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Frmpd1A2AKB4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Frmpd1A2AKB4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Frmpd1A2AKB4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Frmpd1A2AKB4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Frmpd1A2AKB4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Frmpd1A2AKB4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
Frmpd1A2AKB4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Frmpd1A2AKB4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Frmpd1A2AKB4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Frmpd1A2AKB4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Frmpd1A2AKB4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Frmpd1A2AKB4 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Frmpd1A2AKB4 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Frmpd1A2AKB4 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Frmpd1A2AKB4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Frmpd1A2AKB4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Frmpd1A2AKB4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Frmpd1A2AKB4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Frmpd1A2AKB4 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Frmpd1A2AKB4 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Frmpd1A2AKB4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Frmpd1A2AKB4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Frmpd1A2AKB4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Frmpd1A2AKB4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Frmpd1A2AKB4 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Frmpd1A2AKB4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
Frmpd1A2AKB4 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Frmpd1A2AKB4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Frmpd1A2AKB4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Frmpd1A2AKB4 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Frmpd1A2AKB4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Frmpd1A2AKB4 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Frmpd1A2AKB4 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Frmpd1A2AKB4 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Frmpd1A2AKB4 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Frmpd1A2AKB4 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
Frmpd1A2AKB4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Frmpd1A2AKB4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Frmpd1A2AKB4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Frmpd1A2AKB4 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Frmpd1A2AKB4 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Frmpd1A2AKB4 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Frmpd1A2AKB4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Frmpd1A2AKB4 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Frmpd1A2AKB4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Frmpd1A2AKB4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Frmpd1A2AKB4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
Frmpd1A2AKB4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Frmpd1A2AKB4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Frmpd1A2AKB4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Frmpd1A2AKB4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Frmpd1A2AKB4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Frmpd1A2AKB4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
Frmpd1A2AKB4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Frmpd1A2AKB4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Frmpd1A2AKB4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
Frmpd1A2AKB4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Frmpd1A2AKB4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Frmpd1A2AKB4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Frmpd1A2AKB4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Frmpd1A2AKB4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Frmpd1A2AKB4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
Frmpd1A2AKB4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Frmpd1A2AKB4 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Frmpd1A2AKB4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Frmpd1A2AKB4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Frmpd1A2AKB4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Frmpd1A2AKB4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Frmpd1A2AKB4 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Frmpd1A2AKB4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Frmpd1A2AKB4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
Frmpd1A2AKB4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Frmpd1A2AKB4 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Frmpd1A2AKB4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Frmpd1A2AKB4 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Frmpd1A2AKB4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Frmpd1A2AKB4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Frmpd1A2AKB4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Frmpd1A2AKB4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Frmpd1A2AKB4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Frmpd1A2AKB4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Frmpd1A2AKB4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms