Protein–RNA interactions for Protein: A2AGX3

Prdm11, PR domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm11A2AGX3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm11A2AGX3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm11A2AGX3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm11A2AGX3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm11A2AGX3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm11A2AGX3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prdm11A2AGX3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prdm11A2AGX3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prdm11A2AGX3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prdm11A2AGX3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prdm11A2AGX3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prdm11A2AGX3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prdm11A2AGX3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prdm11A2AGX3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prdm11A2AGX3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prdm11A2AGX3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prdm11A2AGX3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prdm11A2AGX3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prdm11A2AGX3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prdm11A2AGX3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prdm11A2AGX3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prdm11A2AGX3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prdm11A2AGX3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prdm11A2AGX3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prdm11A2AGX3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prdm11A2AGX3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prdm11A2AGX3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prdm11A2AGX3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prdm11A2AGX3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prdm11A2AGX3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prdm11A2AGX3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prdm11A2AGX3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prdm11A2AGX3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prdm11A2AGX3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prdm11A2AGX3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prdm11A2AGX3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prdm11A2AGX3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prdm11A2AGX3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prdm11A2AGX3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Prdm11A2AGX3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Prdm11A2AGX3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Prdm11A2AGX3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Prdm11A2AGX3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Prdm11A2AGX3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Prdm11A2AGX3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prdm11A2AGX3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prdm11A2AGX3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prdm11A2AGX3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Prdm11A2AGX3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prdm11A2AGX3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prdm11A2AGX3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prdm11A2AGX3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prdm11A2AGX3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prdm11A2AGX3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prdm11A2AGX3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prdm11A2AGX3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prdm11A2AGX3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prdm11A2AGX3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prdm11A2AGX3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prdm11A2AGX3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prdm11A2AGX3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prdm11A2AGX3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Prdm11A2AGX3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prdm11A2AGX3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prdm11A2AGX3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prdm11A2AGX3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prdm11A2AGX3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prdm11A2AGX3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prdm11A2AGX3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prdm11A2AGX3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prdm11A2AGX3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prdm11A2AGX3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prdm11A2AGX3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prdm11A2AGX3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prdm11A2AGX3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prdm11A2AGX3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prdm11A2AGX3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Prdm11A2AGX3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prdm11A2AGX3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prdm11A2AGX3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prdm11A2AGX3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prdm11A2AGX3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prdm11A2AGX3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prdm11A2AGX3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prdm11A2AGX3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prdm11A2AGX3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdm11A2AGX3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdm11A2AGX3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdm11A2AGX3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdm11A2AGX3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdm11A2AGX3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdm11A2AGX3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdm11A2AGX3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdm11A2AGX3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdm11A2AGX3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prdm11A2AGX3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prdm11A2AGX3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prdm11A2AGX3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prdm11A2AGX3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prdm11A2AGX3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms