Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ckap5A2AGT5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ckap5A2AGT5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ckap5A2AGT5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ckap5A2AGT5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ckap5A2AGT5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ckap5A2AGT5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ckap5A2AGT5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ckap5A2AGT5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ckap5A2AGT5 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ckap5A2AGT5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ckap5A2AGT5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ckap5A2AGT5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ckap5A2AGT5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ckap5A2AGT5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ckap5A2AGT5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ckap5A2AGT5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ckap5A2AGT5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ckap5A2AGT5 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Ckap5A2AGT5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ckap5A2AGT5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ckap5A2AGT5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ckap5A2AGT5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ckap5A2AGT5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ckap5A2AGT5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ckap5A2AGT5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ckap5A2AGT5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ckap5A2AGT5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ckap5A2AGT5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ckap5A2AGT5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ckap5A2AGT5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ckap5A2AGT5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ckap5A2AGT5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ckap5A2AGT5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ckap5A2AGT5 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ckap5A2AGT5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ckap5A2AGT5 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ckap5A2AGT5 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ckap5A2AGT5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ckap5A2AGT5 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ckap5A2AGT5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ckap5A2AGT5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ckap5A2AGT5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ckap5A2AGT5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ckap5A2AGT5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ckap5A2AGT5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ckap5A2AGT5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ckap5A2AGT5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ckap5A2AGT5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ckap5A2AGT5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ckap5A2AGT5 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ckap5A2AGT5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ckap5A2AGT5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ckap5A2AGT5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ckap5A2AGT5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ckap5A2AGT5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ckap5A2AGT5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ckap5A2AGT5 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ckap5A2AGT5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ckap5A2AGT5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ckap5A2AGT5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ckap5A2AGT5 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ckap5A2AGT5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ckap5A2AGT5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ckap5A2AGT5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ckap5A2AGT5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ckap5A2AGT5 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ckap5A2AGT5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ckap5A2AGT5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ckap5A2AGT5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ckap5A2AGT5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ckap5A2AGT5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ckap5A2AGT5 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ckap5A2AGT5 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ckap5A2AGT5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ckap5A2AGT5 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ckap5A2AGT5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ckap5A2AGT5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ckap5A2AGT5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ckap5A2AGT5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ckap5A2AGT5 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ckap5A2AGT5 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ckap5A2AGT5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ckap5A2AGT5 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ckap5A2AGT5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ckap5A2AGT5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ckap5A2AGT5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ckap5A2AGT5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ckap5A2AGT5 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ckap5A2AGT5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ckap5A2AGT5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ckap5A2AGT5 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ckap5A2AGT5 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ckap5A2AGT5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ckap5A2AGT5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ckap5A2AGT5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ckap5A2AGT5 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ckap5A2AGT5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ckap5A2AGT5 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ckap5A2AGT5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms