Protein–RNA interactions for Protein: A2AFH2

Ube2dnl2, Similar to ubiquitin-conjugating enzyme E2D 2, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2dnl2A2AFH2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2dnl2A2AFH2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2dnl2A2AFH2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2dnl2A2AFH2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2dnl2A2AFH2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2dnl2A2AFH2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2dnl2A2AFH2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2dnl2A2AFH2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2dnl2A2AFH2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2dnl2A2AFH2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2dnl2A2AFH2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2dnl2A2AFH2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2dnl2A2AFH2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2dnl2A2AFH2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2dnl2A2AFH2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2dnl2A2AFH2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2dnl2A2AFH2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2dnl2A2AFH2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2dnl2A2AFH2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2dnl2A2AFH2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms