Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itgb4A2A863 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itgb4A2A863 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itgb4A2A863 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itgb4A2A863 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itgb4A2A863 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itgb4A2A863 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itgb4A2A863 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Itgb4A2A863 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itgb4A2A863 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itgb4A2A863 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itgb4A2A863 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itgb4A2A863 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itgb4A2A863 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itgb4A2A863 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itgb4A2A863 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itgb4A2A863 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itgb4A2A863 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itgb4A2A863 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itgb4A2A863 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itgb4A2A863 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itgb4A2A863 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itgb4A2A863 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itgb4A2A863 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itgb4A2A863 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itgb4A2A863 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itgb4A2A863 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itgb4A2A863 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Itgb4A2A863 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itgb4A2A863 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itgb4A2A863 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itgb4A2A863 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itgb4A2A863 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itgb4A2A863 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itgb4A2A863 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itgb4A2A863 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itgb4A2A863 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Itgb4A2A863 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itgb4A2A863 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itgb4A2A863 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itgb4A2A863 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itgb4A2A863 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itgb4A2A863 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itgb4A2A863 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itgb4A2A863 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Itgb4A2A863 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Itgb4A2A863 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itgb4A2A863 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itgb4A2A863 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itgb4A2A863 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itgb4A2A863 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itgb4A2A863 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itgb4A2A863 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itgb4A2A863 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Itgb4A2A863 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itgb4A2A863 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itgb4A2A863 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itgb4A2A863 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itgb4A2A863 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itgb4A2A863 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itgb4A2A863 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itgb4A2A863 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itgb4A2A863 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itgb4A2A863 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itgb4A2A863 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itgb4A2A863 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itgb4A2A863 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itgb4A2A863 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itgb4A2A863 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itgb4A2A863 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itgb4A2A863 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itgb4A2A863 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Itgb4A2A863 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itgb4A2A863 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itgb4A2A863 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itgb4A2A863 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itgb4A2A863 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Itgb4A2A863 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itgb4A2A863 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itgb4A2A863 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itgb4A2A863 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itgb4A2A863 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itgb4A2A863 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itgb4A2A863 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itgb4A2A863 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itgb4A2A863 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itgb4A2A863 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itgb4A2A863 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itgb4A2A863 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itgb4A2A863 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itgb4A2A863 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itgb4A2A863 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itgb4A2A863 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Itgb4A2A863 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itgb4A2A863 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itgb4A2A863 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itgb4A2A863 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itgb4A2A863 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itgb4A2A863 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itgb4A2A863 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms