Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prdm2A2A7B5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prdm2A2A7B5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prdm2A2A7B5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prdm2A2A7B5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prdm2A2A7B5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prdm2A2A7B5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prdm2A2A7B5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prdm2A2A7B5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prdm2A2A7B5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Prdm2A2A7B5 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Prdm2A2A7B5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Prdm2A2A7B5 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Prdm2A2A7B5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Prdm2A2A7B5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Prdm2A2A7B5 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Prdm2A2A7B5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prdm2A2A7B5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prdm2A2A7B5 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prdm2A2A7B5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prdm2A2A7B5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prdm2A2A7B5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prdm2A2A7B5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prdm2A2A7B5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prdm2A2A7B5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prdm2A2A7B5 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prdm2A2A7B5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prdm2A2A7B5 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prdm2A2A7B5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prdm2A2A7B5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prdm2A2A7B5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prdm2A2A7B5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prdm2A2A7B5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prdm2A2A7B5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prdm2A2A7B5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prdm2A2A7B5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prdm2A2A7B5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Prdm2A2A7B5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prdm2A2A7B5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prdm2A2A7B5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prdm2A2A7B5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prdm2A2A7B5 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prdm2A2A7B5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prdm2A2A7B5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prdm2A2A7B5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prdm2A2A7B5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prdm2A2A7B5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prdm2A2A7B5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prdm2A2A7B5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prdm2A2A7B5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prdm2A2A7B5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prdm2A2A7B5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prdm2A2A7B5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prdm2A2A7B5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prdm2A2A7B5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prdm2A2A7B5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prdm2A2A7B5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prdm2A2A7B5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prdm2A2A7B5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prdm2A2A7B5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prdm2A2A7B5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prdm2A2A7B5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prdm2A2A7B5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prdm2A2A7B5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prdm2A2A7B5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prdm2A2A7B5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prdm2A2A7B5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prdm2A2A7B5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prdm2A2A7B5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prdm2A2A7B5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prdm2A2A7B5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prdm2A2A7B5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prdm2A2A7B5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prdm2A2A7B5 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prdm2A2A7B5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prdm2A2A7B5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prdm2A2A7B5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prdm2A2A7B5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prdm2A2A7B5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prdm2A2A7B5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prdm2A2A7B5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prdm2A2A7B5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Prdm2A2A7B5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prdm2A2A7B5 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prdm2A2A7B5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prdm2A2A7B5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prdm2A2A7B5 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prdm2A2A7B5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Prdm2A2A7B5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Prdm2A2A7B5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prdm2A2A7B5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prdm2A2A7B5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prdm2A2A7B5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prdm2A2A7B5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prdm2A2A7B5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Prdm2A2A7B5 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Prdm2A2A7B5 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prdm2A2A7B5 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prdm2A2A7B5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prdm2A2A7B5 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms