Protein–RNA interactions for Protein: A2A3U9

Gm6268, Predicted gene 6268, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6268A2A3U9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm6268A2A3U9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm6268A2A3U9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm6268A2A3U9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm6268A2A3U9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm6268A2A3U9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm6268A2A3U9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm6268A2A3U9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm6268A2A3U9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm6268A2A3U9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm6268A2A3U9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm6268A2A3U9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm6268A2A3U9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm6268A2A3U9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm6268A2A3U9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm6268A2A3U9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm6268A2A3U9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm6268A2A3U9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm6268A2A3U9 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm6268A2A3U9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm6268A2A3U9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm6268A2A3U9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm6268A2A3U9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm6268A2A3U9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm6268A2A3U9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm6268A2A3U9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm6268A2A3U9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm6268A2A3U9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm6268A2A3U9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm6268A2A3U9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm6268A2A3U9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm6268A2A3U9 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm6268A2A3U9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm6268A2A3U9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm6268A2A3U9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm6268A2A3U9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm6268A2A3U9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm6268A2A3U9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm6268A2A3U9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm6268A2A3U9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm6268A2A3U9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm6268A2A3U9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm6268A2A3U9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm6268A2A3U9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm6268A2A3U9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm6268A2A3U9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm6268A2A3U9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm6268A2A3U9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm6268A2A3U9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm6268A2A3U9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm6268A2A3U9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm6268A2A3U9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm6268A2A3U9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm6268A2A3U9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm6268A2A3U9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm6268A2A3U9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm6268A2A3U9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm6268A2A3U9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm6268A2A3U9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm6268A2A3U9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm6268A2A3U9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm6268A2A3U9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm6268A2A3U9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm6268A2A3U9 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm6268A2A3U9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm6268A2A3U9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm6268A2A3U9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm6268A2A3U9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm6268A2A3U9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm6268A2A3U9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm6268A2A3U9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm6268A2A3U9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm6268A2A3U9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm6268A2A3U9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm6268A2A3U9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm6268A2A3U9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm6268A2A3U9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm6268A2A3U9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm6268A2A3U9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm6268A2A3U9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm6268A2A3U9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm6268A2A3U9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm6268A2A3U9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm6268A2A3U9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm6268A2A3U9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm6268A2A3U9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm6268A2A3U9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm6268A2A3U9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm6268A2A3U9 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm6268A2A3U9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm6268A2A3U9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm6268A2A3U9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm6268A2A3U9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm6268A2A3U9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm6268A2A3U9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm6268A2A3U9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm6268A2A3U9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm6268A2A3U9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm6268A2A3U9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm6268A2A3U9 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms