Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trav12-2A0N8N6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trav12-2A0N8N6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trav12-2A0N8N6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trav12-2A0N8N6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trav12-2A0N8N6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trav12-2A0N8N6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trav12-2A0N8N6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trav12-2A0N8N6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trav12-2A0N8N6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trav12-2A0N8N6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trav12-2A0N8N6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trav12-2A0N8N6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trav12-2A0N8N6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trav12-2A0N8N6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trav12-2A0N8N6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trav12-2A0N8N6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav12-2A0N8N6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav12-2A0N8N6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav12-2A0N8N6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav12-2A0N8N6 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav12-2A0N8N6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav12-2A0N8N6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav12-2A0N8N6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav12-2A0N8N6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav12-2A0N8N6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav12-2A0N8N6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav12-2A0N8N6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav12-2A0N8N6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav12-2A0N8N6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav12-2A0N8N6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav12-2A0N8N6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav12-2A0N8N6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav12-2A0N8N6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Trav12-2A0N8N6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav12-2A0N8N6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav12-2A0N8N6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav12-2A0N8N6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav12-2A0N8N6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav12-2A0N8N6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav12-2A0N8N6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav12-2A0N8N6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav12-2A0N8N6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trav12-2A0N8N6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trav12-2A0N8N6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trav12-2A0N8N6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trav12-2A0N8N6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trav12-2A0N8N6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trav12-2A0N8N6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trav12-2A0N8N6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trav12-2A0N8N6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trav12-2A0N8N6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trav12-2A0N8N6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav12-2A0N8N6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav12-2A0N8N6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav12-2A0N8N6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Trav12-2A0N8N6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav12-2A0N8N6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav12-2A0N8N6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav12-2A0N8N6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav12-2A0N8N6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav12-2A0N8N6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav12-2A0N8N6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav12-2A0N8N6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav12-2A0N8N6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav12-2A0N8N6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav12-2A0N8N6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav12-2A0N8N6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav12-2A0N8N6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trav12-2A0N8N6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trav12-2A0N8N6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trav12-2A0N8N6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trav12-2A0N8N6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trav12-2A0N8N6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trav12-2A0N8N6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trav12-2A0N8N6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trav12-2A0N8N6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trav12-2A0N8N6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trav12-2A0N8N6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trav12-2A0N8N6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trav12-2A0N8N6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trav12-2A0N8N6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trav12-2A0N8N6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trav12-2A0N8N6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Trav12-2A0N8N6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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