Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GSI2

1700018G05Rik, RIKEN cDNA 1700018G05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms