Protein–RNA interactions for Protein: A0A0G2JFS9

Atg4a-ps, Cysteine protease, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg4a-psA0A0G2JFS9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg4a-psA0A0G2JFS9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg4a-psA0A0G2JFS9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg4a-psA0A0G2JFS9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atg4a-psA0A0G2JFS9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg4a-psA0A0G2JFS9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg4a-psA0A0G2JFS9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg4a-psA0A0G2JFS9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atg4a-psA0A0G2JFS9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms