Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P8

Trbv13-1, T cell receptor beta, variable 13-1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv13-1A0A0B4J1P8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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