Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P5

Trbv26, T cell receptor beta, variable 26 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv26A0A0B4J1P5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv26A0A0B4J1P5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv26A0A0B4J1P5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv26A0A0B4J1P5 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv26A0A0B4J1P5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trbv26A0A0B4J1P5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trbv26A0A0B4J1P5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trbv26A0A0B4J1P5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trbv26A0A0B4J1P5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trbv26A0A0B4J1P5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trbv26A0A0B4J1P5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trbv26A0A0B4J1P5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trbv26A0A0B4J1P5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trbv26A0A0B4J1P5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trbv26A0A0B4J1P5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trbv26A0A0B4J1P5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trbv26A0A0B4J1P5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trbv26A0A0B4J1P5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trbv26A0A0B4J1P5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trbv26A0A0B4J1P5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Trbv26A0A0B4J1P5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trbv26A0A0B4J1P5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Trbv26A0A0B4J1P5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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