Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P1

Trbv30, T cell receptor beta, variable 30 (Fragment), mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv30A0A0B4J1P1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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