Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Gm43922-201ENSMUST00000205071 328 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Gm30790-201ENSMUST00000208256 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Gm4780-201ENSMUST00000213206 1242 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 AC109212.1-201ENSMUST00000215561 427 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 CT030166.4-201ENSMUST00000220640 404 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 AC154576.2-203ENSMUST00000224736 253 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 AC102291.1-201ENSMUST00000227164 529 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 AC122035.2-201ENSMUST00000228698 462 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
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Hdac5Q9Z2V6 Gm1604a-201ENSMUST00000097422 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Gm10744-201ENSMUST00000220184 2706 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 AC151984.1-201ENSMUST00000218261 2976 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Atr-201ENSMUST00000034980 8056 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Gm12800-201ENSMUST00000075999 1455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Olfr115-202ENSMUST00000221552 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Hdac5Q9Z2V6 Hnrnpa3-203ENSMUST00000111962 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Slc26a1-201ENSMUST00000051757 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Gm4991-201ENSMUST00000118899 1552 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 4930546K05Rik-202ENSMUST00000216586 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Actr10-201ENSMUST00000021479 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Slc22a8-202ENSMUST00000170817 3398 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Nfasc-202ENSMUST00000094569 9739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Heatr5a-201ENSMUST00000040583 7763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Hdac5Q9Z2V6 Olfr860-201ENSMUST00000086482 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Pik3r4-201ENSMUST00000065778 4711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Gm12386-201ENSMUST00000117380 688 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Gm22452-201ENSMUST00000122804 104 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Ly6k-202ENSMUST00000168815 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Gm22408-201ENSMUST00000174925 65 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Gm23639-201ENSMUST00000175078 132 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Obox3-ps4-201ENSMUST00000176026 1005 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Ifi213-205ENSMUST00000180215 643 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Hdac5Q9Z2V6 Gm7436-201ENSMUST00000187229 391 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
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Hdac5Q9Z2V6 Gm42958-201ENSMUST00000197595 318 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Gm43608-201ENSMUST00000197703 687 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Gm42652-201ENSMUST00000199073 614 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 AC117245.2-201ENSMUST00000216943 570 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Hdac5Q9Z2V6 Olfr1257-201ENSMUST00000060795 1016 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Defb26-201ENSMUST00000099205 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Eapp-206ENSMUST00000163433 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 AC122346.2-201ENSMUST00000224326 2931 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
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Hdac5Q9Z2V6 Serpinb7-201ENSMUST00000086690 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Zfp455-202ENSMUST00000120861 2712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Phc3-203ENSMUST00000099163 2808 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Fam102b-201ENSMUST00000046924 5368 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Hdac5Q9Z2V6 Gm27048-201ENSMUST00000182891 4627 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Elmod2-206ENSMUST00000177594 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Hdac5Q9Z2V6 AC154511.1-201ENSMUST00000222578 1587 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 6720475M21Rik-201ENSMUST00000201755 2753 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Smarca1-203ENSMUST00000101616 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Cd44-206ENSMUST00000111192 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Gm38090-201ENSMUST00000195733 1942 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1340-202ENSMUST00000213436 1948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Pcdh11x-201ENSMUST00000050239 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Gm44737-201ENSMUST00000206950 2355 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Phlpp2-203ENSMUST00000179721 7846 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Helz2-203ENSMUST00000121484 10063 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Gm8428-201ENSMUST00000159919 1784 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Ccdc60-201ENSMUST00000050178 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Il13ra2-202ENSMUST00000112827 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Gm42636-201ENSMUST00000197174 2239 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Gm20388-201ENSMUST00000127664 3953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Dennd6a-203ENSMUST00000224111 2692 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Gm45534-201ENSMUST00000211449 2339 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Gm42595-201ENSMUST00000196771 1607 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Igkv4-51-201ENSMUST00000103345 394 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Rps15a-201ENSMUST00000106588 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 A730017C20Rik-203ENSMUST00000118510 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Gm14322-202ENSMUST00000119838 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Amd-ps1-201ENSMUST00000120127 994 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Gm14110-201ENSMUST00000127688 758 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Gm14418-202ENSMUST00000128657 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 1700123O12Rik-202ENSMUST00000141312 660 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 B230118H07Rik-208ENSMUST00000160037 1139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 B230118H07Rik-209ENSMUST00000160722 931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Mir7005-201ENSMUST00000185089 69 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Gm27919-201ENSMUST00000185163 107 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms