Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm20452-201ENSMUST00000174686 513 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm4308-201ENSMUST00000179735 914 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm27659-201ENSMUST00000183472 98 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm4301-201ENSMUST00000186197 914 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm7560-201ENSMUST00000187748 873 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm4312-201ENSMUST00000190264 914 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm37799-201ENSMUST00000194018 547 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm37173-201ENSMUST00000194498 1017 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm37883-201ENSMUST00000194970 725 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm19104-201ENSMUST00000198392 679 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm42982-201ENSMUST00000198574 687 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm7733-201ENSMUST00000199038 919 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Csn1s2a-209ENSMUST00000200322 797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Ube2n-ps1-201ENSMUST00000201768 459 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 A930014E10Rik-201ENSMUST00000205115 546 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Snhg1-211ENSMUST00000206155 605 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Olfr187-201ENSMUST00000206428 978 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm45658-201ENSMUST00000209197 580 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 AC151843.1-201ENSMUST00000215960 691 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm26797-203ENSMUST00000216452 706 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 AC165349.2-201ENSMUST00000219097 426 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 AC113031.2-201ENSMUST00000226132 579 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 AC152394.1-201ENSMUST00000227360 1086 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 AC131029.2-203ENSMUST00000228116 1244 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm7257-201ENSMUST00000041537 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Commd3-201ENSMUST00000061158 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r225-201ENSMUST00000061660 897 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Rpl27a-ps1-201ENSMUST00000075382 448 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Olfr971-201ENSMUST00000075467 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Olfr8-201ENSMUST00000081571 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm24696-201ENSMUST00000083878 134 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Klrk1-202ENSMUST00000095412 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Heph-201ENSMUST00000033553 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Mstn-201ENSMUST00000027269 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Amer1-201ENSMUST00000084535 8496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm43953-201ENSMUST00000203709 2867 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm10706-201ENSMUST00000128327 1960 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Csn1s1-201ENSMUST00000094641 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm4847-201ENSMUST00000046662 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Ube3c-204ENSMUST00000199032 3171 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Ermap-206ENSMUST00000138395 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Fgf1-201ENSMUST00000040647 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm8141-201ENSMUST00000190856 1723 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 AC154141.1-201ENSMUST00000208403 4136 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Tdrkh-204ENSMUST00000196606 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Ndnf-201ENSMUST00000054351 10101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 A230085B16Rik-201ENSMUST00000209781 1856 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 AC162301.1-201ENSMUST00000228785 1542 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm42772-201ENSMUST00000199945 3041 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
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Rabgef1Q9JM13 CT009734.1-201ENSMUST00000227657 1687 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r70-204ENSMUST00000228090 3185 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Ppp1r9a-201ENSMUST00000035813 9547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm38070-201ENSMUST00000191850 6480 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Atp8b5-204ENSMUST00000107942 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Csrnp3-201ENSMUST00000053910 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Focad-201ENSMUST00000097992 5791 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
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Rabgef1Q9JM13 Dock9-208ENSMUST00000212376 8107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 St7-203ENSMUST00000053148 2288 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
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Rabgef1Q9JM13 Olfr381-202ENSMUST00000119863 1065 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm13163-201ENSMUST00000119875 336 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm14939-201ENSMUST00000120347 680 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
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Rabgef1Q9JM13 Gm13874-201ENSMUST00000130680 809 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm13194-201ENSMUST00000142299 311 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm25898-201ENSMUST00000158303 106 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Slc29a1-208ENSMUST00000164769 1226 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm17047-201ENSMUST00000167709 430 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm17223-201ENSMUST00000171413 481 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm5930-202ENSMUST00000178002 489 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm27942-201ENSMUST00000184669 101 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm28894-201ENSMUST00000185214 615 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 C430002N11Rik-204ENSMUST00000190054 443 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm38281-201ENSMUST00000192301 315 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm37369-201ENSMUST00000194179 615 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm43383-201ENSMUST00000195981 469 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm17935-201ENSMUST00000196649 772 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm43471-201ENSMUST00000197550 467 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 D130017N08Rik-204ENSMUST00000199836 506 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm38395-201ENSMUST00000199904 830 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm43979-201ENSMUST00000203179 475 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm44079-201ENSMUST00000204889 529 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Smarca2-238ENSMUST00000208589 1054 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm19170-201ENSMUST00000212440 1084 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Akr1c12-201ENSMUST00000021632 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
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