Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm31659-201ENSMUST00000211989 481 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 AC168056.2-201ENSMUST00000223591 269 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 1810024B03Rik-201ENSMUST00000056146 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Olfr1387-201ENSMUST00000073824 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Nfat5-214ENSMUST00000169453 13380 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm37092-201ENSMUST00000193381 1518 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Odf2l-203ENSMUST00000098539 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm43279-201ENSMUST00000202376 2512 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Ddx4-201ENSMUST00000075748 2762 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Frem1-208ENSMUST00000170248 9527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm19125-201ENSMUST00000188408 1383 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Rspry1-205ENSMUST00000211983 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Olfr972-202ENSMUST00000215303 1641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Synpo2-203ENSMUST00000106427 6937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm43258-201ENSMUST00000200312 1950 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Zmynd11-201ENSMUST00000062658 3796 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Olfr16-202ENSMUST00000215254 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 BC106179-201ENSMUST00000055369 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Lrriq1-201ENSMUST00000020043 2542 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r213-204ENSMUST00000228758 5975 ntAPPRIS P2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Ccdc175-201ENSMUST00000021494 2622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Olfr350-202ENSMUST00000214457 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 C630043F03Rik-201ENSMUST00000122923 2581 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Ttc38-203ENSMUST00000146088 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm12077-201ENSMUST00000117049 364 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm5387-201ENSMUST00000119776 857 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Mcpt2-201ENSMUST00000015576 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm37867-201ENSMUST00000192066 1059 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Ralyl-205ENSMUST00000192209 662 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm37640-201ENSMUST00000195407 300 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Igkv3-8-201ENSMUST00000197635 339 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm31904-201ENSMUST00000219446 877 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Prl8a8-204ENSMUST00000224072 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 AC154767.2-201ENSMUST00000224584 414 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 AC129537.1-201ENSMUST00000226596 1228 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Scgb2b24-201ENSMUST00000055444 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Tas2r134-201ENSMUST00000070028 898 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Spink13-201ENSMUST00000097557 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Adgrl3-205ENSMUST00000117985 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Adgrl3-212ENSMUST00000120144 4999 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Ank1-213ENSMUST00000141784 6566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
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Col5a3Q9JLI2 BC080695-202ENSMUST00000105774 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Chm-202ENSMUST00000113388 4749 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Zfp874a-202ENSMUST00000075255 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Depdc5-205ENSMUST00000120902 5195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Ctage5-202ENSMUST00000069430 2869 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Sytl4-203ENSMUST00000113297 3306 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Mettl4-201ENSMUST00000171284 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Hcrtr2-201ENSMUST00000063140 3761 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Skp2-202ENSMUST00000110585 6185 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm10513-201ENSMUST00000194203 6468 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Arhgap21-213ENSMUST00000173194 6920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Etv1-210ENSMUST00000161980 1939 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Smim15-201ENSMUST00000095458 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Pogz-204ENSMUST00000107269 5966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Olfr943-202ENSMUST00000213176 8275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Zfp87-204ENSMUST00000181767 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Cmah-209ENSMUST00000224953 2221 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Nr1h5-202ENSMUST00000196135 1344 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gbp4-201ENSMUST00000100962 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Olfr161-202ENSMUST00000216259 7133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Sla-201ENSMUST00000100572 2626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Olfr961-202ENSMUST00000219295 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
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Col5a3Q9JLI2 Ccdc47-201ENSMUST00000002043 5193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Tcf7l2-209ENSMUST00000111656 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
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Col5a3Q9JLI2 Gm15080-201ENSMUST00000112804 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Ncoa7-209ENSMUST00000216172 2026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gabrq-201ENSMUST00000033711 2000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
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Col5a3Q9JLI2 Gm27006-201ENSMUST00000182218 943 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Mir6903-201ENSMUST00000183597 88 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm29582-201ENSMUST00000185667 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 1700016L21Rik-201ENSMUST00000187497 394 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm20838-202ENSMUST00000187712 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 1700040F15Rik-201ENSMUST00000188244 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm21996-201ENSMUST00000188269 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm21256-202ENSMUST00000188881 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm28891-202ENSMUST00000189333 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm21094-202ENSMUST00000189577 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm20792-201ENSMUST00000189765 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm28919-201ENSMUST00000190026 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm21861-202ENSMUST00000190806 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm20819-201ENSMUST00000191091 925 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm20871-201ENSMUST00000191322 931 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm21865-202ENSMUST00000191443 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm30737-201ENSMUST00000192683 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Ighv5-19-201ENSMUST00000193466 297 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm35134-201ENSMUST00000194086 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm19900-201ENSMUST00000207285 576 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm38590-201ENSMUST00000209515 970 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm18863-201ENSMUST00000217004 1299 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
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