Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Ap4e1-201ENSMUST00000002063 4600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SrpraQ9DBG7 Acpp-201ENSMUST00000062723 4483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SrpraQ9DBG7 BC067074-201ENSMUST00000078163 3546 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SrpraQ9DBG7 Gm43176-201ENSMUST00000199653 2989 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SrpraQ9DBG7 Myt1l-202ENSMUST00000049784 7202 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SrpraQ9DBG7 Pcdh15-217ENSMUST00000134009 3300 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SrpraQ9DBG7 Ttc41-202ENSMUST00000075632 4366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SrpraQ9DBG7 Serpinb6c-201ENSMUST00000110273 1325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SrpraQ9DBG7 Lilrb4a-201ENSMUST00000217706 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SrpraQ9DBG7 Fut9-201ENSMUST00000084770 12134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SrpraQ9DBG7 Gm42611-201ENSMUST00000199446 3407 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SrpraQ9DBG7 5830416I19Rik-201ENSMUST00000198687 2627 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SrpraQ9DBG7 Bbx-205ENSMUST00000114488 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SrpraQ9DBG7 Gm16142-201ENSMUST00000130584 2850 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SrpraQ9DBG7 Kcnj16-202ENSMUST00000106636 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SrpraQ9DBG7 Olfr311-203ENSMUST00000216473 2961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SrpraQ9DBG7 AC116476.1-201ENSMUST00000226274 2318 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SrpraQ9DBG7 Eppin-201ENSMUST00000103100 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SrpraQ9DBG7 Gm25346-201ENSMUST00000104509 128 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SrpraQ9DBG7 Gm13033-201ENSMUST00000117591 1057 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SrpraQ9DBG7 Nlk-ps1-201ENSMUST00000120843 1230 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SrpraQ9DBG7 Rps29-ps-201ENSMUST00000122083 172 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SrpraQ9DBG7 0610043K17Rik-201ENSMUST00000123107 614 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SrpraQ9DBG7 Gm15503-201ENSMUST00000141541 449 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SrpraQ9DBG7 Gm26162-201ENSMUST00000157793 132 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SrpraQ9DBG7 Gm25487-201ENSMUST00000158725 125 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SrpraQ9DBG7 Serpina3e-ps-201ENSMUST00000165968 1228 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SrpraQ9DBG7 Gm26381-201ENSMUST00000174895 92 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SrpraQ9DBG7 Gm9529-201ENSMUST00000177598 579 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SrpraQ9DBG7 Raet1e-202ENSMUST00000178026 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SrpraQ9DBG7 Mir6921-201ENSMUST00000183719 80 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SrpraQ9DBG7 Gm28586-201ENSMUST00000189857 456 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SrpraQ9DBG7 Gm43838-201ENSMUST00000196357 348 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SrpraQ9DBG7 Mageb16-ps2-201ENSMUST00000204513 1093 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SrpraQ9DBG7 Gm18805-201ENSMUST00000206872 655 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SrpraQ9DBG7 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SrpraQ9DBG7 Gm41231-201ENSMUST00000211525 449 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SrpraQ9DBG7 Gm20163-201ENSMUST00000212232 494 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SrpraQ9DBG7 Gm5055-201ENSMUST00000215697 581 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SrpraQ9DBG7 CT025579.4-201ENSMUST00000224598 627 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SrpraQ9DBG7 Olfr266-201ENSMUST00000059486 1027 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SrpraQ9DBG7 Vmn1r219-201ENSMUST00000076180 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SrpraQ9DBG7 Gm15732-201ENSMUST00000079794 480 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SrpraQ9DBG7 n-R5s56-201ENSMUST00000082521 105 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SrpraQ9DBG7 Gm6990-201ENSMUST00000086830 348 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SrpraQ9DBG7 Raet1d-201ENSMUST00000095795 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SrpraQ9DBG7 Olfr62-203ENSMUST00000217013 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SrpraQ9DBG7 Gm38082-201ENSMUST00000192800 6882 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SrpraQ9DBG7 Ect2l-201ENSMUST00000095817 2900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SrpraQ9DBG7 Kdm5d-201ENSMUST00000055032 7974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SrpraQ9DBG7 Cyb5r2-201ENSMUST00000052438 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SrpraQ9DBG7 Pcsk1-201ENSMUST00000022075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SrpraQ9DBG7 Cfhr2-201ENSMUST00000094489 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SrpraQ9DBG7 Gm38414-201ENSMUST00000209819 1488 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SrpraQ9DBG7 Gm17477-201ENSMUST00000165458 2581 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SrpraQ9DBG7 Ifi207-201ENSMUST00000042610 3422 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SrpraQ9DBG7 Gbp4-201ENSMUST00000100962 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SrpraQ9DBG7 Olfr1175-ps-201ENSMUST00000214207 5552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.36
SrpraQ9DBG7 Tbcel-202ENSMUST00000066179 3893 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
SrpraQ9DBG7 Vmn2r84-201ENSMUST00000094502 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.36
SrpraQ9DBG7 Pou1f1-204ENSMUST00000176330 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SrpraQ9DBG7 1810046K07Rik-201ENSMUST00000039959 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SrpraQ9DBG7 Vmn1r30-202ENSMUST00000226334 1946 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SrpraQ9DBG7 Pcdh15-204ENSMUST00000105426 6802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SrpraQ9DBG7 Helz-203ENSMUST00000106746 13147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SrpraQ9DBG7 Vmn1r220-203ENSMUST00000227679 7868 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SrpraQ9DBG7 Vmn1r220-206ENSMUST00000228854 7854 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SrpraQ9DBG7 Grik2-207ENSMUST00000218823 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SrpraQ9DBG7 Gm45516-201ENSMUST00000211588 4182 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SrpraQ9DBG7 Olfr3-202ENSMUST00000213988 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SrpraQ9DBG7 Olfr1250-202ENSMUST00000111527 4386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SrpraQ9DBG7 Cyp4a10-201ENSMUST00000058785 2109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SrpraQ9DBG7 Gm43707-201ENSMUST00000196451 3187 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SrpraQ9DBG7 Cep120-201ENSMUST00000049811 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SrpraQ9DBG7 Exph5-201ENSMUST00000051014 5957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SrpraQ9DBG7 Prelp-201ENSMUST00000048432 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SrpraQ9DBG7 Atp2b1-201ENSMUST00000020107 7130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SrpraQ9DBG7 Gramd2-203ENSMUST00000128944 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SrpraQ9DBG7 Kcnj16-206ENSMUST00000180023 3701 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SrpraQ9DBG7 Prl8a6-203ENSMUST00000110355 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SrpraQ9DBG7 Ccdc32-202ENSMUST00000110833 732 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SrpraQ9DBG7 Ap3s1-ps1-201ENSMUST00000117113 579 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SrpraQ9DBG7 Gm7212-201ENSMUST00000120817 348 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SrpraQ9DBG7 1700054M17Rik-201ENSMUST00000125654 445 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SrpraQ9DBG7 Gm14974-201ENSMUST00000139112 804 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SrpraQ9DBG7 Gm23903-201ENSMUST00000157566 131 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SrpraQ9DBG7 Gm23343-201ENSMUST00000158964 143 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SrpraQ9DBG7 Gm10177-201ENSMUST00000160052 444 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SrpraQ9DBG7 Gm45844-201ENSMUST00000173842 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SrpraQ9DBG7 Ap3s1-ps2-201ENSMUST00000178107 579 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SrpraQ9DBG7 Gm26820-201ENSMUST00000180764 1008 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SrpraQ9DBG7 Gm8183-201ENSMUST00000183134 980 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SrpraQ9DBG7 Gm27998-201ENSMUST00000184902 361 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SrpraQ9DBG7 Gm28221-201ENSMUST00000185617 347 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SrpraQ9DBG7 Scgb2b33-201ENSMUST00000187413 334 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SrpraQ9DBG7 Ighv8-2-201ENSMUST00000195037 359 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SrpraQ9DBG7 Gm43263-201ENSMUST00000201619 560 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SrpraQ9DBG7 Tbc1d24-213ENSMUST00000201805 3806 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SrpraQ9DBG7 Gm43748-201ENSMUST00000202329 1233 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SrpraQ9DBG7 Gm31897-202ENSMUST00000206231 604 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms