Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Gm6081-201ENSMUST00000134472 489 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Snx20Q9D2Y5 Gm15792-201ENSMUST00000137099 769 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Snx20Q9D2Y5 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Snx20Q9D2Y5 Gm23259-201ENSMUST00000158318 303 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Snx20Q9D2Y5 Lrmda-206ENSMUST00000162540 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Snx20Q9D2Y5 Gm26595-201ENSMUST00000181585 484 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Snx20Q9D2Y5 Gm9658-201ENSMUST00000182757 1012 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Snx20Q9D2Y5 Gm10603-203ENSMUST00000184875 508 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Snx20Q9D2Y5 1110008L16Rik-206ENSMUST00000184980 888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Snx20Q9D2Y5 Gm43383-201ENSMUST00000195981 469 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Snx20Q9D2Y5 Gm43390-201ENSMUST00000196614 421 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Snx20Q9D2Y5 Gm42782-201ENSMUST00000197286 522 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Snx20Q9D2Y5 Gm45042-201ENSMUST00000207377 211 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Snx20Q9D2Y5 AC155709.1-201ENSMUST00000218794 162 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Snx20Q9D2Y5 AC134439.2-201ENSMUST00000221950 467 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Snx20Q9D2Y5 Gm4808-201ENSMUST00000222283 1203 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Snx20Q9D2Y5 Gm33312-201ENSMUST00000222443 332 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Snx20Q9D2Y5 AC154692.1-202ENSMUST00000226632 1231 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Snx20Q9D2Y5 Pifo-202ENSMUST00000066319 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Snx20Q9D2Y5 n-R5s156-201ENSMUST00000083377 105 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Snx20Q9D2Y5 Taar4-201ENSMUST00000092660 1044 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Snx20Q9D2Y5 Bex6-201ENSMUST00000099990 764 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Snx20Q9D2Y5 Gm7903-202ENSMUST00000179953 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Snx20Q9D2Y5 Grin2b-201ENSMUST00000053880 24060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Snx20Q9D2Y5 Synj2bp-203ENSMUST00000163402 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Snx20Q9D2Y5 Gm45633-201ENSMUST00000210669 3253 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Snx20Q9D2Y5 Prom1-205ENSMUST00000165909 4089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Snx20Q9D2Y5 Lgi1-204ENSMUST00000196090 1789 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Snx20Q9D2Y5 Gm42894-201ENSMUST00000200788 3390 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Snx20Q9D2Y5 Zmat4-201ENSMUST00000042352 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Snx20Q9D2Y5 Lrrtm4-208ENSMUST00000147663 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Snx20Q9D2Y5 Gm8005-201ENSMUST00000167326 1401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Snx20Q9D2Y5 Prrc2c-201ENSMUST00000028016 8815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Snx20Q9D2Y5 Gm1966-201ENSMUST00000184540 7293 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Snx20Q9D2Y5 Psg20-202ENSMUST00000108482 1871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Snx20Q9D2Y5 Gm18908-201ENSMUST00000207125 1483 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Snx20Q9D2Y5 Naip6-201ENSMUST00000042220 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Snx20Q9D2Y5 Gm2244-201ENSMUST00000164372 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Snx20Q9D2Y5 Trim24-202ENSMUST00000120238 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Snx20Q9D2Y5 Vmn2r2-201ENSMUST00000077958 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Snx20Q9D2Y5 Prcp-201ENSMUST00000076052 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Snx20Q9D2Y5 Serpinb1c-201ENSMUST00000021834 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Snx20Q9D2Y5 AC134577.3-201ENSMUST00000226490 3000 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Snx20Q9D2Y5 Zfp426-203ENSMUST00000163348 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Snx20Q9D2Y5 Pum2-203ENSMUST00000111123 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Snx20Q9D2Y5 Rabgap1-201ENSMUST00000061179 4967 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Snx20Q9D2Y5 Gm10603-202ENSMUST00000184420 4520 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Snx20Q9D2Y5 Acad11-202ENSMUST00000120854 3108 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Snx20Q9D2Y5 Lats1-203ENSMUST00000217931 4186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Snx20Q9D2Y5 Lats1-201ENSMUST00000040043 4155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Snx20Q9D2Y5 Olfr127-202ENSMUST00000217223 3733 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Snx20Q9D2Y5 Pirt-201ENSMUST00000123434 4200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Snx20Q9D2Y5 Gm18796-201ENSMUST00000190440 1767 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Snx20Q9D2Y5 Epgn-201ENSMUST00000041516 1760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Snx20Q9D2Y5 Skint8-201ENSMUST00000106572 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Snx20Q9D2Y5 Homer1-209ENSMUST00000109496 772 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Snx20Q9D2Y5 Tfpi-207ENSMUST00000111722 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Snx20Q9D2Y5 Gm11858-201ENSMUST00000117935 838 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Snx20Q9D2Y5 Gm13024-201ENSMUST00000121756 718 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Snx20Q9D2Y5 Gm22025-201ENSMUST00000122734 302 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Snx20Q9D2Y5 Tmem216-203ENSMUST00000123788 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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Snx20Q9D2Y5 Mir7685-201ENSMUST00000183555 62 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Snx20Q9D2Y5 2310043O21Rik-201ENSMUST00000185323 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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Snx20Q9D2Y5 1700094M23Rik-202ENSMUST00000198047 675 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Snx20Q9D2Y5 Gm45356-201ENSMUST00000209274 823 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Snx20Q9D2Y5 Gm45693-201ENSMUST00000211391 1157 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Snx20Q9D2Y5 Gm45725-201ENSMUST00000212962 337 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Snx20Q9D2Y5 E130101E03Rik-201ENSMUST00000214469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Snx20Q9D2Y5 AC153847.1-201ENSMUST00000214524 353 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Snx20Q9D2Y5 Gm32899-201ENSMUST00000219694 207 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Snx20Q9D2Y5 CT030657.2-201ENSMUST00000220710 792 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Snx20Q9D2Y5 Gm40653-202ENSMUST00000222122 1155 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Snx20Q9D2Y5 AC129597.1-201ENSMUST00000223046 1234 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Snx20Q9D2Y5 AC129219.1-201ENSMUST00000224336 448 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Snx20Q9D2Y5 CT009539.1-201ENSMUST00000226465 220 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Snx20Q9D2Y5 AC123656.1-201ENSMUST00000227121 581 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Snx20Q9D2Y5 Lgals2-201ENSMUST00000044584 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Snx20Q9D2Y5 Krtap14-201ENSMUST00000099562 216 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Snx20Q9D2Y5 Prl2c3-201ENSMUST00000099805 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Snx20Q9D2Y5 Gm4924-203ENSMUST00000210381 3330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Snx20Q9D2Y5 Gm37943-201ENSMUST00000194053 3944 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Snx20Q9D2Y5 Gm11342-203ENSMUST00000224879 1324 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Snx20Q9D2Y5 Pou2f1-205ENSMUST00000111427 13050 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Snx20Q9D2Y5 Zfp811-202ENSMUST00000200914 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Snx20Q9D2Y5 Gm3512-202ENSMUST00000172431 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Snx20Q9D2Y5 Matr3-ps2-201ENSMUST00000160839 1996 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.5 ms