Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Igkv4-50-201ENSMUST00000103363 352 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Gstm7-202ENSMUST00000106687 743 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Gm14550-201ENSMUST00000117918 407 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Gm11920-201ENSMUST00000118491 563 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Gm11198-201ENSMUST00000119771 974 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Defb28-201ENSMUST00000121912 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Gm13669-201ENSMUST00000122366 457 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Gm15122-201ENSMUST00000135434 462 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Gm25904-201ENSMUST00000158491 143 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Gm26211-201ENSMUST00000158578 129 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Dynlt1a-201ENSMUST00000169415 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Gm17333-201ENSMUST00000169531 378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Scnm1-202ENSMUST00000173462 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Gm20429-202ENSMUST00000174168 820 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Gm9274-201ENSMUST00000182505 984 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Gm28286-201ENSMUST00000188704 586 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Halr1-203ENSMUST00000189071 511 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Gm37380-201ENSMUST00000193752 397 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Gm44374-201ENSMUST00000199821 140 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Gm44097-201ENSMUST00000204112 563 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Smarca2-231ENSMUST00000208091 1140 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Olfr1476-ps1-201ENSMUST00000208572 367 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Gm35454-202ENSMUST00000214817 1101 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 AC139568.1-201ENSMUST00000222878 486 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Krtap13-1-201ENSMUST00000060494 748 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Prcp-201ENSMUST00000076052 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 1700084J12Rik-201ENSMUST00000079057 734 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Klra2-202ENSMUST00000088867 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Gm42541-201ENSMUST00000199871 2249 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Slamf7-202ENSMUST00000192024 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Tdrd3-203ENSMUST00000169504 5280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Olfr770-204ENSMUST00000204712 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Fancd2-208ENSMUST00000204827 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Gm44231-201ENSMUST00000204106 4075 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 AC167013.5-201ENSMUST00000227597 2947 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Olfr1250-202ENSMUST00000111527 4386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Gm45949-201ENSMUST00000221550 1895 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Cpne3-201ENSMUST00000029885 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Sh3d19-201ENSMUST00000107664 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Kcnj16-206ENSMUST00000180023 3701 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Cep55-201ENSMUST00000096096 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Olfr1047-202ENSMUST00000216056 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Nrg1-203ENSMUST00000207470 5415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Vmn2r28-201ENSMUST00000086297 3785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Brwd3-205ENSMUST00000150434 11619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Pum1-202ENSMUST00000097862 3991 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Gm34921-201ENSMUST00000219528 1406 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Gm37911-201ENSMUST00000193099 1545 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Gm40770-201ENSMUST00000220040 1502 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Gm16568-201ENSMUST00000066038 1910 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Gm42397-201ENSMUST00000207472 2002 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Gm10447-201ENSMUST00000084653 2307 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Platr25-201ENSMUST00000143260 2509 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Gm43421-201ENSMUST00000200044 2905 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Csnk1g1-201ENSMUST00000034949 7208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Helz-203ENSMUST00000106746 13147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Pter-203ENSMUST00000134794 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 AC116950.1-201ENSMUST00000226322 3250 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Matr3-205ENSMUST00000186796 1854 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Prep-201ENSMUST00000099858 10933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Ms4a18-201ENSMUST00000177684 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Olfr358-201ENSMUST00000100146 1059 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Gm21719-201ENSMUST00000115940 693 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Gm15596-201ENSMUST00000121139 784 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Gm12451-201ENSMUST00000121636 633 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Sms-ps-201ENSMUST00000121773 1101 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Gm8089-201ENSMUST00000122463 968 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 n-R5s201-201ENSMUST00000122622 116 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Hmgb4os-201ENSMUST00000131581 518 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Gm12119-201ENSMUST00000136083 700 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Gm22223-201ENSMUST00000157360 125 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Gm24239-201ENSMUST00000157791 255 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Gm23071-201ENSMUST00000158242 115 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Speer1-201ENSMUST00000172106 1123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Vmn2r-ps37-201ENSMUST00000174682 1044 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Gm10428-201ENSMUST00000178750 399 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Gm21877-201ENSMUST00000185640 694 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Gm28086-201ENSMUST00000191586 317 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Gm44730-201ENSMUST00000205902 716 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 AC153566.2-201ENSMUST00000213841 330 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 AC129323.1-201ENSMUST00000216733 470 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Gm35188-201ENSMUST00000218869 535 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Gm7413-201ENSMUST00000219498 462 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Gm36756-201ENSMUST00000222011 1214 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 4933433N18Rik-201ENSMUST00000222134 1220 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 AC091783.3-201ENSMUST00000223969 681 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 AC116591.1-201ENSMUST00000227919 351 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Vmn1r74-201ENSMUST00000050416 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Gm6436-201ENSMUST00000077163 451 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Nmur2-201ENSMUST00000037682 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Olfr292-201ENSMUST00000080165 3211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Ifi207-202ENSMUST00000127730 3145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Zfp708-202ENSMUST00000109743 2536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Zfp790-202ENSMUST00000178162 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Olfr745-202ENSMUST00000213127 1930 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 AL607131.1-201ENSMUST00000222575 1835 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Nostrin-201ENSMUST00000041865 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Krcc1-202ENSMUST00000168700 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Otub2-205ENSMUST00000179684 2890 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Usp17la-201ENSMUST00000067695 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms