Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 AC154461.5-201ENSMUST00000225429 774 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 AC125064.1-201ENSMUST00000225801 295 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 AC140288.1-201ENSMUST00000226329 503 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 AC172989.1-201ENSMUST00000226387 513 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 AC154806.1-203ENSMUST00000227370 1032 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 CT025523.1-201ENSMUST00000228318 694 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Klrb1a-201ENSMUST00000032512 1274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Olfr1385-201ENSMUST00000071807 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Mir135a-1-201ENSMUST00000083473 90 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Adam21-201ENSMUST00000008582 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Arl5b-201ENSMUST00000017562 6933 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Ftx-205ENSMUST00000156211 4215 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Slc4a4-203ENSMUST00000130041 3335 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Olfr1362-201ENSMUST00000051874 3045 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Slc22a26-202ENSMUST00000120522 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 AC152922.2-201ENSMUST00000213353 3879 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Zfp825-203ENSMUST00000221173 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Ccdc7a-201ENSMUST00000095158 1547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 AC155234.1-201ENSMUST00000225610 2823 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Gm15789-201ENSMUST00000118992 1359 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Prox1-202ENSMUST00000175916 7913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 CT010577.1-202ENSMUST00000226187 1903 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Pln-201ENSMUST00000046221 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Gm34121-201ENSMUST00000206188 1490 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Gm37755-201ENSMUST00000195880 2179 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Bmi1-202ENSMUST00000051929 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Ccdc7a-202ENSMUST00000108747 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Tlr11-201ENSMUST00000063570 2993 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Golph3l-207ENSMUST00000177390 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Cldn12-202ENSMUST00000115445 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
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Trim12aQ99PQ1 Trim43b-202ENSMUST00000189557 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Gm23485-201ENSMUST00000104181 155 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
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Trim12aQ99PQ1 Gm13930-201ENSMUST00000118569 368 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
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Trim12aQ99PQ1 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
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Trim12aQ99PQ1 4930412L05Rik-202ENSMUST00000146501 1241 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Gm13322-201ENSMUST00000152803 246 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 C230035I16Rik-202ENSMUST00000153753 643 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Gm16231-201ENSMUST00000160432 319 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
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Trim12aQ99PQ1 Smim18-201ENSMUST00000179364 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
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Trim12aQ99PQ1 1700031M16Rik-205ENSMUST00000189907 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 7530428D23Rik-201ENSMUST00000191725 765 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Gm38216-201ENSMUST00000194872 1214 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
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Trim12aQ99PQ1 BC024386-205ENSMUST00000210080 731 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Camta1-213ENSMUST00000214673 243 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
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Trim12aQ99PQ1 Rsad2-201ENSMUST00000020970 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Tenm4-203ENSMUST00000107166 13172 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
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Trim12aQ99PQ1 Pramel7-201ENSMUST00000026957 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
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Trim12aQ99PQ1 Zdhhc11-201ENSMUST00000091493 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 CT030159.2-201ENSMUST00000221233 1742 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Gm10466-201ENSMUST00000101450 2466 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Mef2c-223ENSMUST00000199105 4361 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Gm31049-201ENSMUST00000201516 1302 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Gm28667-201ENSMUST00000189873 2171 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Cd200r4-202ENSMUST00000176321 2005 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Olfr1366-203ENSMUST00000205976 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
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Trim12aQ99PQ1 Pum1-202ENSMUST00000097862 3991 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Pcmtd2-202ENSMUST00000108754 3499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 AC131687.1-201ENSMUST00000225931 5446 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Pcdh15-211ENSMUST00000126920 6866 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Gm24272-201ENSMUST00000102329 98 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Igkv15-103-201ENSMUST00000103324 375 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Ighv5-9-1-201ENSMUST00000103452 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Traj18-201ENSMUST00000103723 66 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Mup1-203ENSMUST00000107499 797 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Rpl21-ps9-201ENSMUST00000119897 482 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Gm15181-201ENSMUST00000120142 177 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Gm14796-201ENSMUST00000121216 959 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Gm2986-201ENSMUST00000121603 382 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Gm12152-201ENSMUST00000122465 684 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Gm12506-201ENSMUST00000123620 806 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 2210411M09Rik-201ENSMUST00000128545 643 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
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