Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Gm12279-201ENSMUST00000142533 294 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm6264-201ENSMUST00000160802 624 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Cldn34a-201ENSMUST00000164764 636 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Snrpe-204ENSMUST00000166915 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm4202-201ENSMUST00000169025 733 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm44370-201ENSMUST00000175436 112 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm27167-201ENSMUST00000183752 511 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm6525-201ENSMUST00000193882 1029 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 1700028E10Rik-206ENSMUST00000202216 557 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm32005-201ENSMUST00000212446 959 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 E130101E03Rik-201ENSMUST00000214469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 4930486F22Rik-201ENSMUST00000218077 559 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Nkain2-204ENSMUST00000218645 703 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 AC123043.1-201ENSMUST00000221068 645 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 AC114008.1-201ENSMUST00000226193 937 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Olfr410-201ENSMUST00000052254 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Lrrc51-202ENSMUST00000098236 949 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Slfn4-203ENSMUST00000215472 1830 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Uevld-201ENSMUST00000094398 4616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm44886-201ENSMUST00000209009 1304 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 AC132465.1-201ENSMUST00000219938 1307 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm38156-201ENSMUST00000194601 2260 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Vangl1-202ENSMUST00000159388 3207 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Rbmy-201ENSMUST00000100360 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm10256-202ENSMUST00000188114 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm21708-203ENSMUST00000190283 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Zfp935-204ENSMUST00000223247 1949 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Foxp2-209ENSMUST00000131414 1381 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm3629-201ENSMUST00000171706 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1299-202ENSMUST00000213511 1783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Lncenc1-202ENSMUST00000179324 2764 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Zfa-ps-202ENSMUST00000180673 3420 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm14245-201ENSMUST00000118939 1843 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Rab30-203ENSMUST00000107180 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm44046-201ENSMUST00000203145 2678 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Olfr97-205ENSMUST00000214848 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Ugt2b38-201ENSMUST00000072818 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 AC103672.2-201ENSMUST00000228146 1687 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Cfap221-201ENSMUST00000037840 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Lrrtm4-201ENSMUST00000074662 3383 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Zfp973-201ENSMUST00000108985 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Plscr2-202ENSMUST00000113044 1239 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm11976-201ENSMUST00000119236 295 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Olfr626-ps1-201ENSMUST00000121147 318 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Rps12-ps20-201ENSMUST00000121168 402 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm13024-201ENSMUST00000121756 718 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm11787-201ENSMUST00000121996 1050 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm14212-201ENSMUST00000122023 826 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm10658-201ENSMUST00000128125 1241 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm20475-201ENSMUST00000174884 263 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm22642-201ENSMUST00000175352 252 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Rps12-ps23-201ENSMUST00000179414 402 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Krtdap-203ENSMUST00000187493 420 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Krtdap-205ENSMUST00000189673 345 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Krtdap-206ENSMUST00000189962 323 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm29605-201ENSMUST00000190800 292 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Krtdap-209ENSMUST00000190990 403 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm37376-201ENSMUST00000192176 453 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm44279-201ENSMUST00000205154 472 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm36696-201ENSMUST00000205418 438 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm45246-201ENSMUST00000210820 367 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 CT030184.2-201ENSMUST00000223064 263 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 AC123665.3-201ENSMUST00000228735 1216 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Spata31d1d-201ENSMUST00000052978 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Olfr424-201ENSMUST00000053941 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Cetn1-201ENSMUST00000062769 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Olfr652-201ENSMUST00000098175 1061 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Krtdap-201ENSMUST00000098559 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Cyld-206ENSMUST00000209559 4476 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm2309-201ENSMUST00000149994 1941 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Olfr292-201ENSMUST00000080165 3211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Nsun6-202ENSMUST00000076435 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1239-203ENSMUST00000217181 1516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Tex11-201ENSMUST00000009814 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Platr8-201ENSMUST00000146110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Ppp1r3b-201ENSMUST00000070481 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm16344-201ENSMUST00000150084 1567 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Pde1c-206ENSMUST00000166890 4728 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 AC153971.1-201ENSMUST00000215097 3811 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm36799-202ENSMUST00000215783 1634 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 1810064F22Rik-203ENSMUST00000188595 2307 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Zfp760-201ENSMUST00000073312 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm37531-201ENSMUST00000191628 5415 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Prrc2c-209ENSMUST00000182593 9022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Zfp607b-202ENSMUST00000120004 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Atf7-210ENSMUST00000184616 7147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Mospd2-202ENSMUST00000112247 2479 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Tlr11-202ENSMUST00000185091 3207 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1391-202ENSMUST00000215671 3235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 CT030181.1-201ENSMUST00000089534 3549 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm6494-201ENSMUST00000218604 2298 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Virma-203ENSMUST00000108307 6571 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm42397-201ENSMUST00000207472 2002 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Ino80d-201ENSMUST00000097718 13675 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Rgsl1-203ENSMUST00000141249 1752 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm22267-201ENSMUST00000104008 131 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm23768-201ENSMUST00000104440 131 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm24989-201ENSMUST00000104461 88 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Cd200r3-205ENSMUST00000114613 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Rpl5-ps2-201ENSMUST00000119057 891 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
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