Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Gm17118-201ENSMUST00000164032 335 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Nup88Q8CEC0 4430402I18Rik-206ENSMUST00000164777 1066 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Nup88Q8CEC0 Gm11107-201ENSMUST00000165414 505 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Nup88Q8CEC0 Gm4904-201ENSMUST00000178243 1195 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Nup88Q8CEC0 Gm27970-201ENSMUST00000184854 407 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Nup88Q8CEC0 Gm37177-201ENSMUST00000193768 417 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Nup88Q8CEC0 Orm1-201ENSMUST00000030044 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Nup88Q8CEC0 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Nup88Q8CEC0 Orm2-201ENSMUST00000075341 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Nup88Q8CEC0 n-R5s89-201ENSMUST00000083532 104 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Nup88Q8CEC0 Vmn1r181-204ENSMUST00000227637 4587 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Nup88Q8CEC0 Pcdh15-204ENSMUST00000105426 6802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Nup88Q8CEC0 Rfx3-201ENSMUST00000046898 4274 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Nup88Q8CEC0 Bbx-201ENSMUST00000066037 4523 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Nup88Q8CEC0 Olfr167-202ENSMUST00000214315 7435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Nup88Q8CEC0 Gm43410-201ENSMUST00000197510 2234 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Nup88Q8CEC0 AA792892-202ENSMUST00000202253 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Nup88Q8CEC0 Olfr720-202ENSMUST00000206298 4437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Nup88Q8CEC0 Zfp607b-202ENSMUST00000120004 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Nup88Q8CEC0 Gm6602-201ENSMUST00000198910 1927 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Nup88Q8CEC0 2900064K03Rik-201ENSMUST00000196567 3113 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Nup88Q8CEC0 Olfr286-201ENSMUST00000073612 3821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Nup88Q8CEC0 Serpina7-202ENSMUST00000060824 1895 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Nup88Q8CEC0 Gm38277-201ENSMUST00000195172 1367 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Nup88Q8CEC0 Vmn1r6-204ENSMUST00000227188 8185 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nup88Q8CEC0 Gm42705-201ENSMUST00000200176 2465 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nup88Q8CEC0 Tbc1d23-203ENSMUST00000226586 3112 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Nup88Q8CEC0 Cacnb4-203ENSMUST00000102761 8039 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nup88Q8CEC0 Synrg-208ENSMUST00000183714 3651 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nup88Q8CEC0 Slc17a3-201ENSMUST00000039721 4276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nup88Q8CEC0 Trappc2-201ENSMUST00000112192 1294 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nup88Q8CEC0 Gm13207-201ENSMUST00000119862 773 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Nup88Q8CEC0 M6pr-ps-201ENSMUST00000120481 830 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Nup88Q8CEC0 Gm15471-201ENSMUST00000145893 625 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nup88Q8CEC0 Gm15819-201ENSMUST00000153089 481 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nup88Q8CEC0 Gm26486-201ENSMUST00000158021 110 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Nup88Q8CEC0 Gm22523-201ENSMUST00000158696 100 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Nup88Q8CEC0 Gm20549-201ENSMUST00000174804 429 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Nup88Q8CEC0 Gm20617-202ENSMUST00000177332 758 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nup88Q8CEC0 Gm10640-202ENSMUST00000190947 1134 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nup88Q8CEC0 Gm43748-201ENSMUST00000202329 1233 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Nup88Q8CEC0 Gm43867-201ENSMUST00000203860 525 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Nup88Q8CEC0 4930518I17Rik-201ENSMUST00000203902 656 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Nup88Q8CEC0 Gm44730-201ENSMUST00000205902 716 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nup88Q8CEC0 Olfr1449-202ENSMUST00000208624 1296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nup88Q8CEC0 Gm45589-201ENSMUST00000209366 895 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nup88Q8CEC0 Olfr291-201ENSMUST00000211582 1159 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nup88Q8CEC0 Gm45899-201ENSMUST00000212196 1276 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Nup88Q8CEC0 Akr1c13-201ENSMUST00000021634 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nup88Q8CEC0 AC153361.2-203ENSMUST00000218083 661 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nup88Q8CEC0 AC154248.1-201ENSMUST00000222072 495 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nup88Q8CEC0 Gm18618-201ENSMUST00000222211 473 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Nup88Q8CEC0 Sfrp4-204ENSMUST00000222992 1062 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nup88Q8CEC0 AC134917.2-201ENSMUST00000223354 124 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Nup88Q8CEC0 Gm24032-201ENSMUST00000083932 159 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Nup88Q8CEC0 Olfr652-201ENSMUST00000098175 1061 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nup88Q8CEC0 Olfr1224-ps1-202ENSMUST00000099793 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nup88Q8CEC0 Gm29274-202ENSMUST00000188814 1498 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nup88Q8CEC0 Sirpb1c-201ENSMUST00000050623 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nup88Q8CEC0 AC130661.1-201ENSMUST00000218248 1680 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Nup88Q8CEC0 Helz-203ENSMUST00000106746 13147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nup88Q8CEC0 Ptprd-213ENSMUST00000173376 4793 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nup88Q8CEC0 AC122828.2-201ENSMUST00000222511 2880 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Nup88Q8CEC0 Ctage5-202ENSMUST00000069430 2869 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nup88Q8CEC0 Trps1-207ENSMUST00000184885 3492 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nup88Q8CEC0 AC155929.3-201ENSMUST00000217963 1428 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nup88Q8CEC0 Mttp-201ENSMUST00000029805 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Efcab2-201ENSMUST00000027775 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm37755-201ENSMUST00000195880 2179 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Plb1-201ENSMUST00000101376 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Zfp708-202ENSMUST00000109743 2536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm10447-201ENSMUST00000084653 2307 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Mbd3l2-202ENSMUST00000213777 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Olfr1175-ps-201ENSMUST00000214207 5552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Vmn1r89-207ENSMUST00000227390 1348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm36186-201ENSMUST00000200820 2052 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm28112-201ENSMUST00000190898 1875 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm42541-201ENSMUST00000199871 2249 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Olfr1226-205ENSMUST00000216445 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm40649-201ENSMUST00000219795 1457 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Qsox2-202ENSMUST00000091263 4011 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Mup1-203ENSMUST00000107499 797 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm7658-201ENSMUST00000119064 1124 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm15149-201ENSMUST00000119370 360 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Rps13-ps6-201ENSMUST00000120038 428 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Vmn1r-ps111-201ENSMUST00000121014 997 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Vmn1r208-201ENSMUST00000124841 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 1700054M17Rik-201ENSMUST00000125654 445 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm15642-201ENSMUST00000148057 311 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm25675-201ENSMUST00000174979 118 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm26509-201ENSMUST00000180947 948 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Scgb2b12-201ENSMUST00000183195 511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm8506-201ENSMUST00000186661 829 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 1700104B16Rik-202ENSMUST00000187948 722 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm28620-201ENSMUST00000190463 439 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm38237-201ENSMUST00000193366 376 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm37223-206ENSMUST00000195070 699 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 9430087J23Rik-201ENSMUST00000195414 1152 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm43157-201ENSMUST00000198223 412 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm5717-201ENSMUST00000198243 1062 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
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