Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Gm26289-201ENSMUST00000104169 131 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Gm13469-201ENSMUST00000118231 350 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Gm11987-201ENSMUST00000118524 381 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Gm7058-201ENSMUST00000119209 902 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Gm13338-201ENSMUST00000120235 361 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Gm12963-203ENSMUST00000156271 388 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Gm25904-201ENSMUST00000158491 143 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Gm10603-203ENSMUST00000184875 508 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Gm4332-201ENSMUST00000196114 346 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Gm36793-201ENSMUST00000199211 922 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 311 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Gm45473-201ENSMUST00000211452 616 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Gsta4-201ENSMUST00000034903 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Olfr796-201ENSMUST00000037071 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Olfr1491-201ENSMUST00000052737 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Gm26442-201ENSMUST00000082588 153 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 n-R5s58-201ENSMUST00000093682 119 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Cldn34b3-201ENSMUST00000096389 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Sgms2-201ENSMUST00000090246 5801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Csnk1g1-201ENSMUST00000034949 7208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Scn1a-202ENSMUST00000094951 5946 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 AC164107.1-202ENSMUST00000228953 1816 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Slc7a11-201ENSMUST00000029297 9223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Themis-203ENSMUST00000105516 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 AC130831.1-201ENSMUST00000224546 1474 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Malat1-201ENSMUST00000172812 6983 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r15-201ENSMUST00000228297 2021 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Akap4-203ENSMUST00000115751 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Cep170-201ENSMUST00000057037 6930 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Arhgap32-201ENSMUST00000168954 8703 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Adgrg6-203ENSMUST00000208429 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 9830132P13Rik-201ENSMUST00000198240 4187 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Igkv4-50-201ENSMUST00000103363 352 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Gm12369-201ENSMUST00000121343 942 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Gm4789-201ENSMUST00000121708 1216 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Gm13480-201ENSMUST00000125095 1000 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 G930045G22Rik-202ENSMUST00000161723 673 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Gm24812-201ENSMUST00000175315 284 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Gm21877-201ENSMUST00000185640 694 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Gm37265-201ENSMUST00000191698 885 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Slamf7-205ENSMUST00000194791 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Gm37901-201ENSMUST00000195107 514 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Gm43354-201ENSMUST00000196862 346 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Gm18290-201ENSMUST00000202900 844 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Gm5306-201ENSMUST00000203325 757 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Gm44442-201ENSMUST00000204298 422 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Fxyd1-212ENSMUST00000206305 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Gm45448-201ENSMUST00000211739 209 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Gm7413-201ENSMUST00000219498 462 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 AC105950.1-201ENSMUST00000222637 408 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 CT025579.4-201ENSMUST00000224598 627 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 CT030238.4-202ENSMUST00000226143 745 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 AC123533.2-201ENSMUST00000228176 375 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 1700084J12Rik-201ENSMUST00000079057 734 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 1700109H08Rik-201ENSMUST00000008451 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Gm42507-201ENSMUST00000201187 2555 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Olfr1179-202ENSMUST00000213157 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Hnrnpc-207ENSMUST00000227536 1301 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Pcdh15-214ENSMUST00000129404 6857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Them5-202ENSMUST00000198083 1378 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Lrp2-201ENSMUST00000080953 15460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Rprd2-201ENSMUST00000090791 7756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Ezh1-203ENSMUST00000107285 4193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Gm44215-201ENSMUST00000204910 2711 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Tnik-206ENSMUST00000160518 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Ranbp17-201ENSMUST00000037522 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Gm43612-201ENSMUST00000196087 3207 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Adam34-202ENSMUST00000212185 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Gm36640-201ENSMUST00000203686 5934 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Gm38142-201ENSMUST00000194093 3555 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Ank3-239ENSMUST00000183148 7404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Tcf7-201ENSMUST00000086844 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 P2ry13-201ENSMUST00000040622 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Gm20877-201ENSMUST00000100105 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Olfr26-201ENSMUST00000104874 931 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 4930503H13Rik-201ENSMUST00000118320 725 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Gm11925-201ENSMUST00000121375 535 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Gm25962-201ENSMUST00000157173 168 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Gm20917-201ENSMUST00000179922 990 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 7630403G23Rik-201ENSMUST00000184229 1084 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Trav1-202ENSMUST00000185651 329 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Gm38303-201ENSMUST00000192603 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Gm6119-201ENSMUST00000193443 1206 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Gm38291-201ENSMUST00000193671 259 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Gm42707-201ENSMUST00000196620 322 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Gm43561-201ENSMUST00000199866 448 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 4930480K02Rik-201ENSMUST00000203679 1054 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Pttg1-202ENSMUST00000020687 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Gm45267-201ENSMUST00000211028 522 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Gm45479-201ENSMUST00000211613 802 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Gm30933-201ENSMUST00000217174 381 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Gm10037-203ENSMUST00000221620 636 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 AC113031.1-201ENSMUST00000227400 432 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Uqcrh-ps1-201ENSMUST00000038391 270 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 n-R5s180-201ENSMUST00000082770 106 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Sult2a3-201ENSMUST00000098809 1018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Morc2b-202ENSMUST00000131954 3857 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Trappc8-201ENSMUST00000025177 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Pou1f1-204ENSMUST00000176330 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms