Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 AW554918-208ENSMUST00000165400 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 AW554918-202ENSMUST00000097643 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Angptl1-201ENSMUST00000027885 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm34294-201ENSMUST00000191912 4263 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Tcf7l2-213ENSMUST00000111662 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15950-201ENSMUST00000162902 1973 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Peak1-204ENSMUST00000188142 7524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 AC115760.1-201ENSMUST00000225160 1327 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 AC122305.1-201ENSMUST00000214803 3921 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12040-201ENSMUST00000118357 537 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12115-201ENSMUST00000119969 447 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 M6pr-ps-201ENSMUST00000120481 830 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 AI646519-201ENSMUST00000140987 351 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 1600029O15Rik-201ENSMUST00000178259 517 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Mlip-214ENSMUST00000185039 1295 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37475-201ENSMUST00000193107 1015 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37477-201ENSMUST00000195215 884 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Elk3-205ENSMUST00000223340 750 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 A2m-201ENSMUST00000032203 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13043-201ENSMUST00000178489 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44229-201ENSMUST00000203211 2487 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn2r-ps44-201ENSMUST00000174053 2412 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Usp17la-201ENSMUST00000067695 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Ampd3-201ENSMUST00000005829 4094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Cfap221-202ENSMUST00000174370 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18878-201ENSMUST00000223071 1443 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp263-207ENSMUST00000162207 2452 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4787-201ENSMUST00000062182 2474 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Kif2a-204ENSMUST00000122233 3533 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Maml2-201ENSMUST00000034401 2098 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp317-203ENSMUST00000213725 2354 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Apol10a-201ENSMUST00000060551 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Nsun6-202ENSMUST00000076435 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn2r97-201ENSMUST00000168710 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13641-201ENSMUST00000117993 473 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7058-201ENSMUST00000119209 902 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Serpina3e-ps-201ENSMUST00000165968 1228 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20926-201ENSMUST00000194457 696 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3970-201ENSMUST00000198001 334 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45326-201ENSMUST00000209234 721 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 4930486F22Rik-201ENSMUST00000218077 559 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
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Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1259-202ENSMUST00000214846 4325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
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Ccdc88cQ6VGS5 Cyp2c69-201ENSMUST00000168838 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
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Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1377-202ENSMUST00000213291 2441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Anapc10-203ENSMUST00000210812 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 1810046K07Rik-201ENSMUST00000039959 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
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Ccdc88cQ6VGS5 BC061195-201ENSMUST00000088133 577 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 1700003E24Rik-201ENSMUST00000088134 577 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Pde4b-207ENSMUST00000106908 4304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8246-202ENSMUST00000180788 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Yme1l1-201ENSMUST00000028117 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn2r-ps54-202ENSMUST00000150147 2952 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Foxp2-204ENSMUST00000115472 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm36981-201ENSMUST00000192340 4485 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 AC134577.3-201ENSMUST00000226490 3000 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20768-201ENSMUST00000199527 2338 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Nmrk1-201ENSMUST00000042392 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r44-210ENSMUST00000227747 1811 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Pax5-201ENSMUST00000014174 8004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37730-201ENSMUST00000192432 2211 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr370-202ENSMUST00000209408 4600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Tex48-201ENSMUST00000102861 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14391-202ENSMUST00000109055 965 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11787-201ENSMUST00000121996 1050 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14419-203ENSMUST00000156844 752 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Mir6992-201ENSMUST00000183342 109 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.7 ms