Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Gm19340-201ENSMUST00000221995 345 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Gm18618-201ENSMUST00000222211 473 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 AC154481.1-201ENSMUST00000223532 331 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Lrrc51-201ENSMUST00000078448 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Olfr472-203ENSMUST00000216937 5392 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Rs1-201ENSMUST00000033650 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Gbp2b-201ENSMUST00000029936 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Gm18879-201ENSMUST00000221187 1537 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 A930017M01Rik-201ENSMUST00000081361 2884 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Gm43113-201ENSMUST00000199713 1754 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Olfr1299-202ENSMUST00000213511 1783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Nxf7-202ENSMUST00000113163 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Gm37262-201ENSMUST00000192816 1818 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Ugt2a1-201ENSMUST00000147854 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Gm43031-201ENSMUST00000198500 1887 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Gm14849-201ENSMUST00000122293 2846 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Adgrg6-203ENSMUST00000208429 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Atp13a5-201ENSMUST00000075806 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Arhgap32-201ENSMUST00000168954 8703 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Iqca-201ENSMUST00000113094 3210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Lmbrd2-201ENSMUST00000090380 3210 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Ranbp17-201ENSMUST00000037522 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Olfr1183-202ENSMUST00000213115 8258 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Mapk10-205ENSMUST00000128869 2518 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Rgsl1-203ENSMUST00000141249 1752 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Tcrg-V6-201ENSMUST00000103555 403 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Gm24888-201ENSMUST00000104387 130 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Apoa2-203ENSMUST00000111320 470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Apoa2-204ENSMUST00000111321 518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Gm21103-201ENSMUST00000112737 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Rpl12-ps1-201ENSMUST00000116168 498 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Gm12874-201ENSMUST00000117190 913 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Gm8692-201ENSMUST00000118102 438 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Gm11920-201ENSMUST00000118491 563 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Gm12119-201ENSMUST00000136083 700 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 AI662270-203ENSMUST00000145461 592 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Gm11963-201ENSMUST00000149826 500 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Gm3047-201ENSMUST00000164069 822 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
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Usp49Q6P9L4 Gm3029-201ENSMUST00000168306 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Gm5225-201ENSMUST00000178572 324 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
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Usp49Q6P9L4 Mhrt-202ENSMUST00000185798 447 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 1700044C05Rik-201ENSMUST00000186060 898 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 2310008N11Rik-201ENSMUST00000189978 568 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Txndc9-203ENSMUST00000192960 472 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Gm37223-206ENSMUST00000195070 699 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Gm43057-201ENSMUST00000196789 429 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Gm44225-201ENSMUST00000203582 186 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Gm44020-201ENSMUST00000204618 664 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 2310008N11Rik-203ENSMUST00000210732 601 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
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Usp49Q6P9L4 AC102312.1-203ENSMUST00000219530 763 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
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Usp49Q6P9L4 CT010456.3-201ENSMUST00000221210 523 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 AC154323.2-201ENSMUST00000226557 1151 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
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Usp49Q6P9L4 Platr26-201ENSMUST00000079720 641 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Vmn1r183-201ENSMUST00000086012 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Gm10205-201ENSMUST00000087431 234 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Mrgprb5-201ENSMUST00000094389 1037 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Calcoco2-202ENSMUST00000097162 968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Trp63-208ENSMUST00000115310 5366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Gm12299-201ENSMUST00000138819 2327 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Sbf2-208ENSMUST00000166020 5481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Fbxw22-201ENSMUST00000080626 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Cpeb4-202ENSMUST00000109412 6303 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
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Usp49Q6P9L4 Ogfod1-203ENSMUST00000109556 5310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Vmn1r86-203ENSMUST00000227220 6445 ntAPPRIS P2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 AC154630.1-201ENSMUST00000215334 2440 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
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Usp49Q6P9L4 Top3b-203ENSMUST00000119787 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Snx10-207ENSMUST00000179365 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Specc1-201ENSMUST00000049836 6091 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Olfr10-202ENSMUST00000217290 2776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Cd69-201ENSMUST00000032259 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Gm37255-201ENSMUST00000193302 3060 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Gm32568-201ENSMUST00000212782 1421 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Wdr7-201ENSMUST00000072726 7109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Ccr9-201ENSMUST00000111454 2620 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Wars2-201ENSMUST00000004343 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Gm8246-202ENSMUST00000180788 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Gm26707-201ENSMUST00000181552 3902 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Nsun6-202ENSMUST00000076435 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Rabep1-207ENSMUST00000178245 2460 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Gsdme-202ENSMUST00000101405 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Gm38377-201ENSMUST00000193253 3772 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Prdx2-rs3-201ENSMUST00000117259 594 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Gm5601-201ENSMUST00000118909 972 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Gm16095-201ENSMUST00000128235 253 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Gm15859-201ENSMUST00000132069 710 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Gm11368-201ENSMUST00000139576 609 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Gm26486-201ENSMUST00000158021 110 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Vmn2r-ps37-201ENSMUST00000174682 1044 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 n-R5s109-201ENSMUST00000179195 119 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Gm26877-201ENSMUST00000180728 633 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms